特定の列から大文字を GREP し、結果を新しい列と同じファイルにパイプします。

Question 1

grep には列を指定するためのオプションやパラメータはありますか?

グレップ持っていないフィールドセパレータオプション。
次のものを使用してくださいawk代わりに次のアプローチをとります:

awk -F'\t' -v OFS='\t' '{match($19,/[A-Z]+/); $20=substr($19,RSTART,RLENGTH) FS $20}1' 1.table

match($19,/[A-Z]+/)- 19番目のフィールド内の大文字をキャプチャします

$20=substr($19,RSTART,RLENGTH) FS $20- 一致する大文字を抽出します19thフィールドとして挿入し、20フィールド値

Answer

grep には列を指定するためのオプションやパラメータはありますか?

グレップ持っていないフィールドセパレータオプション。
次のものを使用してくださいawk代わりに次のアプローチをとります:

awk -F'\t' -v OFS='\t' '{match($19,/[A-Z]+/); $20=substr($19,RSTART,RLENGTH) FS $20}1' 1.table

match($19,/[A-Z]+/)- 19番目のフィールド内の大文字をキャプチャします

$20=substr($19,RSTART,RLENGTH) FS $20- 一致する大文字を抽出します19thフィールドとして挿入し、20フィールド値

Question 2

どうやってそれをするかというあなたの文字通りの質問に答えるためにgrep 一人でgrepそのために設計されていないにもかかわらず、GNUgrepと PCRE サポートを使用してビルドすると、次の操作を実行できます。

grep -Po '(?:^(?:[^\t]*\t){18}|\G)[^\t]*?\K[[:upper:]]'

これは、<not-TABs><tab>行の先頭の18個のシーケンス、または前の一致の末尾（\G）の後に、可能な限り最小数の非タブ文字（つまり、まだ19番目のフィールドにある）と大文字の文字が続くものを検索しますが、で\K先頭をリセットします。一致したその大文字の直前の部分。

次のような入力があった場合:

X<tab>X<tab>....<tab>AbC<tab>X<tab>...

報告内容は以下のとおりです。

A
C

あなたのアプローチのようにcut | grep。

19 番目のフィールドの最初の大文字のみに興味がある場合は、次のように簡略化できます。

grep -Po '^(?:[^\t]*\t){18}[^\t]*?\K[[:upper:]]'

20番目として挿入するにはカラム、次のようにすることができます:

paste <(cut -f1-19 < file) <(grep ...above < file) <(cut -f20- < file) > newfile

または、最後の列として挿入するには:

grep... < file | paste file - > newfile

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