Ubuntu 12.04 LTS 64 ビット バージョンでNGS QC Toolkit を実行しようとしましたhttp://59.163.192.90:8080/ngsqctoolkit/
。しかし、コマンドを実行した後、正常にインストールしたにもかかわらず、モジュールが見つからないためインストールする必要があるというエラーが表示されますString::Approx
。
私が使用したコマンドは次のとおりです。
perl ~/Programs/NGSQCToolkit_v2.3/QC/IlluQC_PRLL.pl -c 2 -pe /home/shrujan/Desktop/NGS_Shrujan/SRR072111_1.fastq /home/shrujan/Desktop/NGS_Shrujan/SRR072111_2.fastq 2
A Error:
Can not find module 'String::Approx'
Install it and try again
この問題の解決方法をご指導ください。
答え1
次のコマンドを実行します。
shrujan@ubuntu:~$ cpan
cpan[1] install String::Approx
NGSQCToolをお試しください