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特定のパターンとすべての値を持つ列を印刷する

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特定のパターンとすべての値を持つ列を印刷する

次のようなファイルがあります:

     OV2  OVI  1VI  OV3  3VI  
er    23   23   23   23   23  
tr    24   24   24   24   24

名前に含まれる列とともに 1 列目を印刷しますVI(どの列に文字列が含まれるかは事前にわかりません)。上記の例では、出力は次のようになります。

     OVI  1VI  3VI  
er    23   23   23     
tr    24   24   24

すべての列はタブで区切る必要があります。

答え1

perl -lane '$,="\t";
   $. == 1 and @A = grep $F[$_] =~ /VI/, 0..$#F;
   print @F[0,@A];
' yourfile

結果

ID      OVI     1VI     3VI
er      23      23      23
tr      24      24      24

働く

  • 最初の行から、$. == 1文字列を含むフィールドのインデックスを抽出しますVI。
  • 配列 内のこれらのインデックスのリストを使用して、配列から@A最初のフィールドと配列にリストされているフィールドを切り出します。は に設定されています。YMMV。@A@FOFS=$,TAB

awk

awk -v OFS="\t" '
   NR==1{
      for ( i=2; i<=NF; i++ )
         if ( $i ~ /VI/ )
            str = str OFS i
      N = split(str, A, OFS)
   }{
      s = $1
      for ( i=2; i<=N; i++ )
         s = s OFS $(A[i])
      $0 = s
   }1
' yourfile

翻訳

sed -e '
   # TAB->spc, multiple spc -> single spc, trim leading/trailing spc
   y/ / /;s/[ ]\{2,\}/ /g;s/^[ ][ ]*//;s/[ ][ ]*$//

   # only for first line, remove the first field and store remaining in hold area
   1{
      h
         s/[ ]/\
/
         s/.*\n//
      x
   }

   # append hold area (which now has 2nd...last fields
   # data of the first record) to the present line and
   # place a marker at the end of the first field
   G
   s/[^ ][^ ]*[ ]/&\
/

   # setup a do-while loop which progressively either keeps VI data or trims it
   :loop
      #  1     2                      3
      s/\(\n\)\([^ ][^ ]*\)[ ]\{0,1\}\(.*\n\)[^ ]*VI[^ ]*[ ]\{0,1\}/ \2\1\3/;tloop
      s/\(\n\)[^ ][^ ]*[ ]\{0,1\}\(.*\n\)[^ ][^ ]*[ ]\{0,1\}/\1\2/
   /\n\n$/!bloop
   # loop ends when the two \ns collide at the end of line

   # remove the two \ns and what remains is what you wanted
   s///

' yourfile

答え2

awk解決：

awk 'BEGIN{FS="[\t ]+"; OFS="\t"}NR==1{for(i=2;i<=NF;i++)
    {if($i~/VI/) a[i]; }}{r=$1; for(i in a) r=r OFS $i; print l}' file

出力：

    OVI 1VI 3VI
er  23  23  23
tr  24  24  24

  • FS="[\t ]+"- 入力フィールドセパレーター

  • OFS="\t"- 出力フィールドセパレーター

  • NR==1- 初めてヘッダライン

  • if($i~/VI/) a[i]- 一致する場合はフィールド番号をキャプチャするVI

  • r=$1; for(i in a) r=r OFS $i; print r- 必要なフィールド番号を反復処理し、それぞれの値を出力する

順序が崩れる場合は、次の withasorti()関数を使用します (配列をインデックスでソートするため)。

awk 'BEGIN{FS="[\t ]+"; OFS="\t"}NR==1{for(i=2;i<=NF;i++)
    {if($i~/VI/) a[i]; }}{r=$1; asorti(a,b); for(i in b) {r=r OFS $(b[i])} print r}' file

答え3

Python スクリプト ソリューション。最初の行を解析し、列のリストを構築するという基本操作を行います。VI が含まれていない列は None に設定されます。他のすべての行は単語に分割され、比較のために列リスト項目とペアに結合されます。対応する列項目が None の場合、現在の行のその単語は印刷されません。それ以外の場合は、None ではないものが印刷されます。

#!/usr/bin/env python3
import sys

with open(sys.argv[1]) as fd:
    indexes = []
    for index,line in enumerate(fd):
        if index == 0:
            columns = line.strip().split()
            for i,col in enumerate(columns):
                if 'VI' in col or i == 0:
                    indexes.append(col)
                else:
                    indexes.append(None)
            for x in indexes:
                if x:
                    print(x,end=" ")
            print("")
            continue
        for j in zip(line.strip().split(),indexes):
            if j[1]:
                print(j[0],end=" ")
        print("")

注:タブ区切りの出力にするにend=" "は、 を置き換えます。end="\t"

テスト走行：

$ ./get_colums.py input.txt                                                                                              
ID  OVI 1VI 3VI 
er  23  23  23  
tr  24  24  24

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