大きなファイルから最初のフィールド/列が重複している行を削除する

大きなファイルから最初のフィールド/列が重複している行を削除する

非常に大きなファイルがあります (以下のスニペット)。最初の列の数字が上の行から連続して増加しない行を削除する必要があります。

たとえば、最初の列の識別子が「40812」であるスニペットの最初の行を保持します。次に、40813最初の列に「 」がある行 (この例では行 3) を保持し、次に「 」で始まる行40814などを保持します。2 行目など、この連続性に違反する行はすべて削除します。

これまでの質問/回答で解決策を探してみましたが、今のところ成功していません。いくつかの質問で紹介されている解決策は次のとおりです。

awk -F',' ' '!seen[$1]++ myFile

私は次のように考えた別の解決策を採用しました。

sort -t':' -k 1,1 -u myFile

どこが間違っているのか教えていただけるとありがたいです。私はファイル操作の経験があまりありません。

 40812        20406.000000         0.843859468      1083.209050130      -994.562279080      -993.349611938        22.120868921
 40829        20414.500000         0.891283743      1144.084593627      -994.539001565      -993.349739827        21.177788019
 40813        20406.500000         0.829362077      1064.599666089      -994.546948121      -993.348764740        22.087239027
 40830        20415.000000         0.889606427      1141.931529727      -994.537943593      -993.350242614        21.282490969
 40814        20407.000000         0.822524589      1055.822814442      -994.540118434      -993.348757318        22.083606005
 40831        20415.500000         0.875230513      1123.478077086      -994.523844766      -993.350421831        20.606467962
 40815        20407.500000         0.823511602      1057.089780943      -994.541681744      -993.349315083        22.432111979
 40832        20416.000000         0.846150258      1086.149592126      -994.494220141      -993.349798791        22.309054136
 40816        20408.000000         0.824550451      1058.423286012      -994.543159511      -993.349731194        22.481428146
 40833        20416.500000         0.811604775      1041.805740021      -994.458563132      -993.348626225        21.118428946
 40834        20417.000000         0.787796672      1011.244783236      -994.434062658      -993.347887110        20.963790894
 40817        20408.500000         0.819160081      1051.504008955      -994.537767061      -993.349702160        22.268819809
 40835        20417.500000         0.784857495      1007.471947645      -994.431441227      -993.348167742        20.731789112
 40818        20409.000000         0.807571275      1036.628191427      -994.525675417      -993.349169067        22.332761049
 40836        20418.000000         0.799208319      1025.893192994      -994.446595759      -993.348938468        21.268665075
 40819        20409.500000         0.797104599      1023.192780242      -994.514563564      -993.348491176        22.622548103
 40837        20418.500000         0.819797939      1052.322786256      -994.467698852      -993.349417295        21.013041973
 40820        20410.000000         0.796605925      1022.552664951      -994.513928312      -993.348319789        22.193170071

答え1

これはまさに次のような点awkで優れています:

$ awk '{ if(NR==1 || $1 == last+1){print; last=$1}}' file
 40812        20406.000000         0.843859468      1083.209050130      -994.562279080      -993.349611938        22.120868921
 40813        20406.500000         0.829362077      1064.599666089      -994.546948121      -993.348764740        22.087239027
 40814        20407.000000         0.822524589      1055.822814442      -994.540118434      -993.348757318        22.083606005
 40815        20407.500000         0.823511602      1057.089780943      -994.541681744      -993.349315083        22.432111979
 40816        20408.000000         0.824550451      1058.423286012      -994.543159511      -993.349731194        22.481428146
 40817        20408.500000         0.819160081      1051.504008955      -994.537767061      -993.349702160        22.268819809
 40818        20409.000000         0.807571275      1036.628191427      -994.525675417      -993.349169067        22.332761049
 40819        20409.500000         0.797104599      1023.192780242      -994.514563564      -993.348491176        22.622548103
 40820        20410.000000         0.796605925      1022.552664951      -994.513928312      -993.348319789        22.193170071

あるいは、ちょっとゴルフをしてみましょう:

$ awk '(NR==1 || $1 == last+1) && last=$1' file
 40812        20406.000000         0.843859468      1083.209050130      -994.562279080      -993.349611938        22.120868921
 40813        20406.500000         0.829362077      1064.599666089      -994.546948121      -993.348764740        22.087239027
 40814        20407.000000         0.822524589      1055.822814442      -994.540118434      -993.348757318        22.083606005
 40815        20407.500000         0.823511602      1057.089780943      -994.541681744      -993.349315083        22.432111979
 40816        20408.000000         0.824550451      1058.423286012      -994.543159511      -993.349731194        22.481428146
 40817        20408.500000         0.819160081      1051.504008955      -994.537767061      -993.349702160        22.268819809
 40818        20409.000000         0.807571275      1036.628191427      -994.525675417      -993.349169067        22.332761049
 40819        20409.500000         0.797104599      1023.192780242      -994.514563564      -993.348491176        22.622548103
 40820        20410.000000         0.796605925      1022.552664951      -994.513928312      -993.348319789        22.193170071

説明

  • if(NR==1 || $1 == last+1): はNR現在の行番号です。したがって、NR == 1ファイルの最初の行を読み取っている間のみ true になります。常に最初の行を印刷するためにこれが必要です。次に、行の最初のフィールド ( ) が変数に格納されている値に 1 を加えた値に等しい$1 == last +1場合、は true になります。まとめると、これは「これが最後の行であるか、最初のフィールドが last + 1 に等しい場合」を意味し、ターゲット行を定義します。$1last
  • print; last=$1: 上記の2つの条件のいずれかが真の場合、行を出力し、の値をのlast最初のフィールドに設定します。これ次の行を処理できるようにします。

関連情報