PCIe の正確な仕様はわかりませんが、グラフィック カードなどに半分の長さの接点があることは珍しくありません。これにより、ライブで接続された場合に早期の接触を防ぐことができます。
あなたの写真では、ピンの端の上に明らかに傷がついていますが、端自体は四角く見えます。これは意図的であることを示しています。
また、矢印で示されている摩耗の線を見ると、コネクタが完全に挿入されたときに接点が到達する場所です。綿棒と接点クリーナーを使用して、優しく清掃してみてください。
USB も同様です。電源投入前にデータが接続されるのを防ぐために、2 つの短いピンがあります。