答え1
あなたの具体的な質問については、もう一度確認したほうがいいと思います。ブックマーク ファイルは、実際にはあなたが言及したディレクトリにあります (Ubuntu インストールで再確認したところ、すべてのブックマークがそこにあります)。ファイルは次のとおりです。
~/.config/google-chrome/Default/Bookmarks
しかし、一般的に、ブックマークをバックアップする最も簡単な方法は、Chrome を Google アカウントにログインして、ブックマークを Google に同期することです。こうすることで、再インストール後でも、サインインするとすぐにブックマークが復元されます。
答え2
Chrome 自体の「ブックマークをエクスポート」機能を使用して、希望の場所に保存できるバックアップ ファイルを作成することもできます。