
以下の MWE を試してください。コメント行のコメントを解除し、前の行をコメントアウトすると、2 つの `mdframed' 環境間のスペースが大幅に増加します。
\documentclass{llncs}
\usepackage{lipsum}
\usepackage[framemethod=TikZ]{mdframed}
\newmdenv[linecolor=gray!50,backgroundcolor=gray!25,roundcorner=.25em]{darkgraybox}
\newmdenv[linecolor=gray!50,backgroundcolor=gray!10,roundcorner=.25em]{lightgraybox}
\begin{document}
\lipsum*[1]
%\lipsum*[1-2]
\vspace*{2mm}
\begin{darkgraybox}
\lipsum[1]
\end{darkgraybox}
\vspace*{2mm}
\begin{lightgraybox}
\lipsum[1]
\end{lightgraybox}
\vspace*{2mm}
\begin{darkgraybox}
\lipsum[1]
\end{darkgraybox}
\lipsum[1-5]
\end{document}