
次のグラフィックに触発されて、tikz でコピーしてみました。いくつかの詳細を変更したいと思います。
- 色付きの背景の縁は均一である必要があります。
- アミノ酸間の結合は望ましくありません。分離している方が望ましいです。
これが私の最初の試みです:
\documentclass{standalone}%
\usepackage[ngerman]{babel}
\usepackage{tikz}
\usetikzlibrary{arrows,decorations.pathmorphing,backgrounds,positioning,fit,petri}
\usepackage{chemfig,xstring}
\begin{document}
\setatomsep{2.5em}
\setcrambond{2pt}{}{}
\begin{tikzpicture}[
point/.style={circle,draw=none,minimum size=#1},
point/.default=0pt % default Wert für minimum size bei point]
\foreach \anfang/\ende/\farbe in { 25/100/green!60,104/170/orange!60,174 /254/red!60, 258/314/yellow!60, 318/381/blue!60}
\draw[fill=\farbe,draw=none] (0,0) -- (\anfang:12cm) arc (\anfang:\ende:12cm);
\draw[fill=white,draw=none] (0,0) circle (6cm);
% mit count=\i werden die Kreise nummeriert
% der zugehörige Winkel wird mit evaluate aus dieser Nummer berechnet
% insgesamt werden (bis zu) 20 Kreise auf 360 Grad gleichmäßig verteilt
\foreach[count=\i,evaluate=\i as \angle using (\i-1)*360/20] \text in {%
1,2,3,4,\begin{tiny}\schemestart \chemnameinit{}\chemname{\chemfig{C(=[3]O)(-[1]OH)(-[6]CH_2(-[6]CH(-[5]NH_2)(-[7]C(=[6]O)(-[1]OH))))}}{Asparaginsäure\\Asp\\D} \schemestop\end{tiny},\begin{tiny}\schemestart \chemnameinit{} \chemname{\chemfig{CH(-[3]NH_2)(-[1]C(=[2]OH)(-[7]OH))(-[6]CH_2(-[6]C(=[5]O)(-[7]NH_2)))}}{Asparagin\\Asn\\N}\schemestop\end{tiny},7,8,9,10,11,12,13,14,15,16,17,18,19,20% Beschriftung der Kreise
}
\node[point=2.2em] (node\i) at (\angle:9) {\text};
\end{tikzpicture}
\end{document}
私は別の TeX ファイルにアミノ酸の構造を記述し、通常は コマンドを使用します\input
。MWE の場合、2 つのアミノ酸で十分なはずです。
ノード/アミノ酸を回転させて内側の円の中心を指すようにするにはどうすればよいでしょうか?
代替の解決策も歓迎します。
大変申し訳ございませんが、自分の質問にコメントすることはできないため、ここに情報を追加します。
@Alenanno 非常に役立つ回答をありがとうございました。
同じグラフィックは欲しくありません。実際、これまでのところ、すべての構造式が色付きの円内にあり、中心からほぼ同じ距離にある状態が気に入っています。
次のステップは、外側の説明(小さい、極性(親水性)など)です。可能であれば、それぞれ管理できれば、説明を色付きの円の内側の縁にある構造式の下に置きたいと思います。
単一ノードのアドレス指定方法を教えてください。
\aminoacid コマンドを何のために定義しましたか? - MWE からは取得できませんでした
挨拶する
@Alenanno: まさにそれが私が望んでいたことです! ありがとうございます! 承認ボタンの横に回答をマークする機能はありますか?
答え1
rotate=\angle-90
foreach によって印刷されたノードに追加できます。
編集:OP に画像を表示したくないので、修正版を以下に示します。中央に白い円を「カット」せずに、色付きの円弧を描くことができることに注意してください。これは修正しました。説明は希望どおりになっていると思います (ドイツ語の文字は修正する必要があります)。色を付けたくない場合は、\color{\farbe}
コードから行を削除してください。
編集2:別のバージョンについては以下を参照してください。
出力
コード
\documentclass[margin=10pt]{standalone}%
\usepackage[ngerman]{babel}
\usepackage{tikz}
\usetikzlibrary{calc, arrows,decorations.pathmorphing,backgrounds,positioning,fit,petri, intersections, decorations.text}
\usepackage{pgfmath}
\usepackage{chemfig,xstring}
\tikzset{
point/.style={minimum size=#1},
point/.default=0pt,
bent text/.style={postaction={
decorate,
decoration={
text along path,
reverse path=true,
text align/align=center,
text={| \Large\bfseries\color{\farbe}|#1}
}
}
}
}
\def\colorlist{{"green!60", "orange!60", "red!60", "yellow!60", "blue!60"}}
\begin{document}
\setatomsep{2.5em}
\setcrambond{2pt}{}{}
\begin{tikzpicture}\tiny
\foreach \anfang/\ende/\descr [count=\ix starting from 0] in {%
25/100/{klein polar (hydrophil)},
104/170/{groß, polar (hydrophil)},
174/254/{mittiere Polarität},
258/314/{groß unpolar},
318/381/{klein, unpolar}}{
\pgfmathsetmacro\farbe{\colorlist[\ix]}
\fill[\farbe] (\anfang:6cm) -- (\anfang:12cm) arc (\anfang:\ende:12cm) -- (\ende:6cm) arc (\ende:\anfang:6cm);
\path[bent text={\descr}] (\anfang:5cm) arc (\anfang:\ende:5cm);
}
% mit count=\i werden die Kreise nummeriert
% der zugehörige Winkel wird mit evaluate aus dieser Nummer berechnet
% insgesamt werden (bis zu) 20 Kreise auf 360 Grad gleichmäßig verteilt
\foreach [count=\i, evaluate=\i as \angle using int((\i-1)*360/20), evaluate=\i as \midangle using int((\i-1.5)*360/20), remember=\midangle as \lastmid (initially -27)] \text in {%
1,2,3,4,
\schemestart \chemnameinit{}\chemname{\chemfig{C(=[3]O)(-[1]OH)(-[6]CH_2(-[6]CH(-[5]NH_2)(-[7]C(=[6]O)(-[1]OH))))}}{Asparaginsäure\\Asp\\D} \schemestop,
\schemestart \chemnameinit{} \chemname{\chemfig{CH(-[3]NH_2)(-[1]C(=[2]OH)(-[7]OH))(-[6]CH_2(-[6]C(=[5]O)(-[7]NH_2)))}}{Asparagin\\Asn\\N}\schemestop
,7,8,9,10,11,12,13,14,15,16,17,18,19,20% Beschriftung der Kreise
}{
\node[point=2.2em, rotate=\angle-90] (node\i) at (\angle:9) {\text};
}
\end{tikzpicture}
\end{document}
OPにマッチする
あなたのイメージに合う別のバージョンがここにあります。
出力
コード
\documentclass[margin=10pt]{standalone}%
\usepackage[ngerman]{babel}
\usepackage{tikz}
\usetikzlibrary{calc, arrows,decorations.pathmorphing,backgrounds,positioning,fit,petri, intersections, decorations.text}
\usepackage{pgfmath}
\usepackage{chemfig,xstring}
\definecolor{xlime}{RGB}{228,246,13}
\definecolor{xpink}{RGB}{245,109,175}
\definecolor{xorange}{RGB}{232,117,53}
\definecolor{xgreen}{RGB}{151,184,43}
\definecolor{xblue}{RGB}{144,181,236}
\tikzset{
point/.style={minimum size=#1},
point/.default=0pt,
bent text/.style={postaction={
decorate,
decoration={
text along path,
reverse path=true,
text align/align=center,
text={| \Large\bfseries\color{\farbe}|#1}
}
}
}
}
\newcommand\aminoacids[4][black]{
\node[point=2.2em, minimum width=5cm,rotate=\angle-90, inner sep=2mm] (node#2) at (#3) {#4};
\path[green, name path=around] (node#2.north west) -- (node#2.north east) -- (node#2.south east) -- (node#2.south west) -- cycle;
\path[name path={tris#2}] (\midangle:12cm) -- (0,0) -- (\lastmid:12cm) -- cycle;
\path[name intersections={of={tris#2} and around, name=i, total=\t}];
\begin{scope}[on background layer]
\filldraw[draw=black, fill=#1] (i-1) -- (i-2) -- (i-4) -- (i-3) -- cycle;
\end{scope}
}
\def\colorlist{{"xgreen", "xorange", "xpink", "xlime", "xblue"}}
\begin{document}
\setatomsep{2.5em}
\setcrambond{2pt}{}{}
\begin{tikzpicture}\tiny
\foreach \anfang/\ende/\descr [count=\ix starting from 0] in {%
25/100/{klein polar (hydrophil)},
104/170/{groß, polar (hydrophil)},
174/254/{mittiere Polarität},
258/314/{groß unpolar},
318/381/{klein, unpolar}}{%
\pgfmathsetmacro\farbe{\colorlist[\ix]}
\path[bent text={\descr}] (\anfang:5cm) arc (\anfang:\ende:5cm);
}
\foreach [count=\i,
evaluate=\i as \angle using int((\i-1)*360/20),
evaluate=\i as \midangle using int((\i-1.5)*360/20),
evaluate=\midangle as \lastmid using int((\i-.5)*360/20)
]
\text/\colr in {%
1/0,2/0,3/0,4/0,
\schemestart \chemnameinit{}\chemname{\chemfig{C(=[3]O)(-[1]OH)(-[6]CH_2(-[6]CH(-[5]NH_2)(-[7]C(=[6]O)(-[1] OH))))}}{Asparaginsäure\\Asp\\D} \schemestop/0,
\schemestart \chemnameinit{} \chemname{\chemfig{CH(-[3]NH_2)(-[1]C(=[2]OH)(-[7]OH))(-[6]CH_2(-[6]C(=[5]O)(-[7] NH_2)))}}{Asparagin\\Asn\\N}\schemestop/0
,7/1,8/1,9/1,10/2,11/2,12/2,13/3,14/3,15/3,16/3,17/4,18/4,19/4,20/4% Beschriftung der Kreise
}{
\pgfmathsetmacro\farbe{\colorlist[\colr]}
\aminoacids[\farbe]{\i}{\angle:9}{\text}
}
\end{tikzpicture}
\end{document}