レポート用に LaTeX で接尾辞ツリーを描画しようとしています。ツリーをプログラミングしているので、手動で作成する手間を省くために、コードから qtree 形式でツリーを印刷するだけです。
小さな木の場合、これはうまく機能します。(いつもの「バナナ」の例が来ます)
\documentclass{article}
\usepackage{graphics}
\usepackage{qtree}
\begin{document}
\begin{center}
\Tree[. [.\$ ]
[.banana\$ ]
[.a [.n [.a [.na\$ ]
[.\$ ]
] ] [.\$ ]
] [.n [.a [.na\$ ]
[.\$ ]
] ] ]
\end{center}
\end{document}
しかし、「idontknowsomethingbig」のようなもっと大きなツリーを描きたい場合も、同じプロセスを使用します。
\documentclass{article}
\usepackage{graphics}
\usepackage{qtree}
\begin{document}
\begin{center}
\Tree[. [.\$idontknowsomethingbig\$ ]
[.i [.dontknowsomethingbig\$ ]
[.ngbig\$ ]
[.g\$ ]
] [.dontknowsomethingbig\$ ]
[.o [.ntknowsomethingbig\$ ]
[.wsomethingbig\$ ]
[.methingbig\$ ]
] [.n [.tknowsomethingbig\$ ]
[.owsomethingbig\$ ]
[.gbig\$ ]
] [.t [.knowsomethingbig\$ ]
[.hingbig\$ ]
] [.knowsomethingbig\$ ]
[.wsomethingbig\$ ]
[.somethingbig\$ ]
[.methingbig\$ ]
[.ethingbig\$ ]
[.hingbig\$ ]
[.g [.big\$ ]
[.\$ ]
] [.big\$ ]
]
\end{center}
\end{document}
私が得たのはこれだけ
入力に応じて、最後のブランチが取得される場合もあれば、この場合のように単語だけが取得される場合もあります。
私の推測では、コードは構文的には正しく、問題はコードが大きすぎて LaTeX が混乱していることにあります。しかし、私の知る限り、何でもあり得ます。
答え1
コメントで説明されている問題は、qツリー14 以上の枝は処理できません。解決策は、代わりに forest を使用することです。これにより、次のような大きな木を描画できるようになりました。
それは次のことから来ています:
\documentclass[border=1mm]{standalone}
\usepackage{graphics}
\usepackage{forest}
\begin{document}
\begin{forest}
for tree={
calign=center,
grow'=east,
parent anchor=east, child anchor=west,
text height=1.4ex, text depth=0.2ex
}
[. [.\$GATTACATAGCTGATGCTAGCTATATCGTCGATGCGCTCGCGATAGCTAGCTAGTCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
[.G [.A [.T [.TACATAGCTGATGCTAGCTATATCGTCGATGCGCTCGCGATAGCTAGCTAGTCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
[.G [.C [.TAGCTATATCGTCGATGCGCTCGCGATAGCTAGCTAGTCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
[.GCTCGCGATAGCTAGCTAGTCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
] ] [.AGCTAGCTAGTCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
[.CTGS\$ ]
] ] [.C [.T [.GATGCTAGCTATATCGTCGATGCGCTCGCGATAGCTAGCTAGTCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
[.A [.G [.C [.T [.A [.TATCGTCGATGCGCTCGCGATAGCTAGCTAGTCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
[.GTCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
] ] ] [.TCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
] [.T [.ATCGTCGATGCGCTCGCGATAGCTAGCTAGTCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
[.GATCTGS\$ ]
] ] [.CGCGATAGCTAGCTAGTCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
] [.G [.CTCGCGATAGCTAGCTAGTCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
[.ATAGCTAGCTAGTCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
] ] [.T [.C [.G [.ATGCGCTCGCGATAGCTAGCTAGTCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
[.TAGCTATGATCTGS\$ ]
] ] [.AGCTATGATCTGS\$ ]
] [.S\$ ]
] [.A [.T [.TACATAGCTGATGCTAGCTATATCGTCGATGCGCTCGCGATAGCTAGCTAGTCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
[.A [.G [.C [.T [.GATGCTAGCTATATCGTCGATGCGCTCGCGATAGCTAGCTAGTCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
[.AGCTAGTCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
] ] ] [.TCGTCGATGCGCTCGCGATAGCTAGCTAGTCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
] [.G [.C [.TAGCTATATCGTCGATGCGCTCGCGATAGCTAGCTAGTCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
[.GCTCGCGATAGCTAGCTAGTCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
] [.ATCTGS\$ ]
] [.C [.GTCGATGCGCTCGCGATAGCTAGCTAGTCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
[.TGS\$ ]
] ] [.CATAGCTGATGCTAGCTATATCGTCGATGCGCTCGCGATAGCTAGCTAGTCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
[.G [.C [.T [.GATGCTAGCTATATCGTCGATGCGCTCGCGATAGCTAGCTAGTCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
[.A [.T [.ATCGTCGATGCGCTCGCGATAGCTAGCTAGTCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
[.GATCTGS\$ ]
] [.G [.CTAGTCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
[.TCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
] ] ] ] [.TCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
] ] [.T [.TACATAGCTGATGCTAGCTATATCGTCGATGCGCTCGCGATAGCTAGCTAGTCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
[.A [.CATAGCTGATGCTAGCTATATCGTCGATGCGCTCGCGATAGCTAGCTAGTCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
[.G [.C [.T [.GATGCTAGCTATATCGTCGATGCGCTCGCGATAGCTAGCTAGTCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
[.A [.T [.ATCGTCGATGCGCTCGCGATAGCTAGCTAGTCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
[.GATCTGS\$ ]
] [.G [.CTAGTCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
[.TCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
] ] ] ] [.TCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
] [.T [.ATCGTCGATGCGCTCGCGATAGCTAGCTAGTCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
[.CGTCGATGCGCTCGCGATAGCTAGCTAGTCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
[.GATCTGS\$ ]
] ] [.G [.A [.T [.GCTAGCTATATCGTCGATGCGCTCGCGATAGCTAGCTAGTCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
[.CTGS\$ ]
] ] [.C [.TAGCTATATCGTCGATGCGCTCGCGATAGCTAGCTAGTCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
[.GCTCGCGATAGCTAGCTAGTCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
] [.S\$ ]
] [.C [.G [.T [.CGATGCGCTCGCGATAGCTAGCTAGTCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
[.AGCTATGATCTGS\$ ]
] [.ATGCGCTCGCGATAGCTAGCTAGTCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
[.CGATAGCTAGCTAGTCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
] [.TGS\$ ]
] ] [.C [.ATAGCTGATGCTAGCTATATCGTCGATGCGCTCGCGATAGCTAGCTAGTCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
[.T [.G [.ATGCTAGCTATATCGTCGATGCGCTCGCGATAGCTAGCTAGTCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
[.S\$ ]
] [.A [.G [.C [.T [.A [.TATCGTCGATGCGCTCGCGATAGCTAGCTAGTCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
[.GTCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
] ] ] [.TCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
] [.T [.ATCGTCGATGCGCTCGCGATAGCTAGCTAGTCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
[.GATCTGS\$ ]
] ] [.CGCGATAGCTAGCTAGTCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
] [.G [.T [.CGATGCGCTCGCGATAGCTAGCTAGTCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
[.AGCTATGATCTGS\$ ]
] [.A [.T [.GCGCTCGCGATAGCTAGCTAGTCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
[.AGCTAGCTAGTCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
] ] [.C [.TCGCGATAGCTAGCTAGTCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
[.GATAGCTAGCTAGTCGTAGCTATGATCTGS\$ ]
] ] ] [.S\$ ]
]
\end{forest}
\end{document}
の構文forest
は と異なるqtree
ため、この例ではすべてのノードに余分な「.」文字があります。この回答を forest を使用してツリーを構築する方法の例として使用している場合には、この点に留意してください :)