私はUbuntu 16.04とR 3.4.3を使用しています。
install.packages("geojson", dep=TRUE)
R では、次のエラーが発生します。
依存関係 'protolite' はパッケージ 'geojson' では使用できません
だから私は走る
install.packages("protolite", dep=TRUE)
その結果、私は次の結論を得ました:
Configuration failed because protobuf was not found. Try installing:
* deb: libprotobuf-dev (Debian, Ubuntu, etc)
* rpm: protobuf-devel (Fedora, EPEL)
* csw: protobuf_dev (Solaris)
* brew: protobuf (OSX)
If protobuf is already installed, check that 'pkg-config' is in your
PATH and PKG_CONFIG_PATH contains a protobuf.pc file. If pkg-config
is unavailable you can set INCLUDE_DIR and LIB_DIR manually via:
R CMD INSTALL --configure-vars='INCLUDE_DIR=... LIB_DIR=...'
しかし、protoc --version
ターミナルで実行すると
libprotoc 2.6.1
最新バージョンがインストールされているようです。コピーしprotobuf.pc
て/usr/lib/pkconfig/
設定しPKG_CONFIG_PATH
て みました
export PKG_CONFIG_PATH=/usr/lib/pkgconfig
pkg-config
成功しませんでした。が にある かどうかを確認する方法も、後者のマニュアルの指示に従う方法もわかりません。特に、およびPATH
にどのディレクトリを書き込むべきかわかりません。INCLUDE_DIR=...
LIB_DIR=...
どうすればいいでしょうか?
答え1
以下の手順でRパッケージをインストールできます。
#1. add R 3.4.3 repository if not added before
cat <<EOF | sudo tee /etc/apt/sources.list.d/r-cran.list
deb https://cloud.r-project.org/bin/linux/ubuntu xenial/
EOF
sudo apt-key adv --keyserver keyserver.ubuntu.com --recv-keys E084DAB9
#2. add repository for libjq-dev
sudo add-apt-repository -y ppa:opencpu/jq
#3. update package lists
sudo apt-get update
#4. install R and dependencies
sudo apt-get install r-base-dev r-base-core libjq-dev libcurl4-openssl-dev \
libssl-dev libprotobuf-dev libjq-dev libv8-3.14-dev protobuf-compiler
#5. launch R and install geojson package:
R
> install.packages("geojson", dep=TRUE)
答え2
私の/usr/bin/pkg-config
(Ubuntu 18.04 にバンドルされているバージョン 0.29.1) には非常に多くのバグがあることが分かりました。PKG_CONFIG_PATH で指定されたディレクトリを調べません (カスタム ディレクトリはデバッグ出力に表示されませんでした)。ソースから新しいバージョン (0.29.2) をビルドする必要がありました。これで問題は解決しました。
誰かの役に立てば幸いです