Wie behebt man einen Perl-Modulfehler beim Versuch, NGS QC Toolkit auszuführen?

Wie behebt man einen Perl-Modulfehler beim Versuch, NGS QC Toolkit auszuführen?

Ich habe versucht, NGS QC Toolkit in der 64-Bit-Version von Ubuntu 12.04 LTS auszuführen http://59.163.192.90:8080/ngsqctoolkit/. Aber nach der Ausführung des Befehls wird ein Fehler angezeigt, der besagt, dass das Modul nicht gefunden werden kann String::Approxund installiert werden muss, obwohl ich es erfolgreich installiert habe.

Hier ist der Befehl, den ich verwendet habe:

perl ~/Programs/NGSQCToolkit_v2.3/QC/IlluQC_PRLL.pl -c 2 -pe /home/shrujan/Desktop/NGS_Shrujan/SRR072111_1.fastq /home/shrujan/Desktop/NGS_Shrujan/SRR072111_2.fastq 2 
A Error:
    Can not find module 'String::Approx'
    Install it and try again

Bitte helfen Sie mir, dieses Problem zu lösen.

Antwort1

Führen Sie die folgenden Befehle aus:

shrujan@ubuntu:~$ cpan

cpan[1] install String::Approx

Dann probieren Sie Ihr NGSQCTool

verwandte Informationen