Ich habe versucht, NGS QC Toolkit in der 64-Bit-Version von Ubuntu 12.04 LTS auszuführen http://59.163.192.90:8080/ngsqctoolkit/
. Aber nach der Ausführung des Befehls wird ein Fehler angezeigt, der besagt, dass das Modul nicht gefunden werden kann String::Approx
und installiert werden muss, obwohl ich es erfolgreich installiert habe.
Hier ist der Befehl, den ich verwendet habe:
perl ~/Programs/NGSQCToolkit_v2.3/QC/IlluQC_PRLL.pl -c 2 -pe /home/shrujan/Desktop/NGS_Shrujan/SRR072111_1.fastq /home/shrujan/Desktop/NGS_Shrujan/SRR072111_2.fastq 2
A Error:
Can not find module 'String::Approx'
Install it and try again
Bitte helfen Sie mir, dieses Problem zu lösen.
Antwort1
Führen Sie die folgenden Befehle aus:
shrujan@ubuntu:~$ cpan
cpan[1] install String::Approx
Dann probieren Sie Ihr NGSQCTool