Hallo, ich bin neu bei Linux. Ich habe zwei Dateien, von denen eine die Sequenz-ID (Datei_1) hat und die andere die Sequenz-ID mit Sequenz (Datei_1). Ich muss tun, ob die Sequenz-ID (Datei_1), die in Datei_1 vorhanden ist, in einer neuen Datei gespeichert werden soll.
Beispiel: Datei_1
lcl|NW_002477239.1_gene_517
lcl|NW_002477243.1_gene_364
lcl|NW_002477248.1_gene_148
lcl|NW_002477249.1_gene_419
lcl|NW_002477249.1_gene_95
Datei_2
>lcl|NW_002477253.1_gene_1
TGATGGAAGCTTCCAATTCTCCCGACCAACAATCAGTGCTCAGTGAATCTATCCTTGTTAGCGAGTCGCTTGTTCCA
>lcl|NW_002477239.1_gene_517
ATGGCTGATTTTGCAAAGGATCCTGCTCTCAACGCAGCATTATCTGCACCATGGGCGTTTCTCTGCCCTACATCAGAATTAAACGATACCATA
Erwartete Ausgabe:
>lcl|NW_002477239.1_gene_517
ATGGCTGATTTTGCAAAGGATCCTGCTCTCAACGCAGCATTATCTGCACCATGGGCGTTTCTCTGCCCTACATCAGAATTAAACGATACCATA
Bitte helfen Sie mir, dieses Problem zu lösen.
Antwort1
Sie können dieses Bash-Skript verwenden, um Ihr Ergebnis mit Übereinstimmungen zu erhalten
!#/bin/bash
while read line
do
grep $line File_2 >> file
done <./File_1