☰

Abgleichen und Drucken mehrerer Spalten aus zwei Dateien

tag-icon • tag-icon linux awk grep
Abgleichen und Drucken mehrerer Spalten aus zwei Dateien

Ich habe zwei Dateien. Ich muss in beiden Dateien gemeinsame Zeilen basierend auf Spalte1 finden und wenn sie übereinstimmen, diese in eine neue Datei schreiben: col1 (gemeinsam für beide Dateien) file1col2 und file2col2

Datei1:

col1                         file1col2
10:100000525-100001560(+)    0.971465226620556
10:100001724-100002618(+)    0.940918504451204
10:100002725-100002970(+)    0.946592696189412
10:100003104-100004184(+)    0.736305487299153
10:100004450-100005051(+)    0.70823022283736
10:100005158-100005876(+)    0.969728923411704
10:100006075-100007551(+)    0.855411430976336
10:100007764-100009009(+)    0.274219271261146
10:100009146-100011362(+)    0.927057564779308
10:100011583-100011887(+)    0.883431738847249

Datei2

col1                         file2col2
10:100000525-100001560(+)    0.943385996874889
10:100001724-100002618(+)    0.981929023174133
10:100002725-100002970(+)    0.955549170283206
10:100003104-100004184(+)    0.736440826679551
10:100004450-100005051(+)    0.689045711238636
10:100005158-100005876(+)    0.964995337925152
10:100006075-100007551(+)    0.873411848029685
10:100007764-100009009(+)    0.37719743446494
10:100009146-100011362(+)    0.943862343124518
10:100011583-100011887(+)    0.902915705720447

gewünschte Ausgabe

col1(common between two files)  file1col2   file2col2
10:100000525-100001560(+)   0.971465227 0.943385997
10:100001724-100002618(+)   0.940918504 0.981929023
10:100002725-100002970(+)   0.946592696 0.95554917
10:100003104-100004184(+)   0.736305487 0.736440827
10:100004450-100005051(+)   0.708230223 0.689045711
10:100005158-100005876(+)   0.969728923 0.964995338
10:100006075-100007551(+)   0.855411431 0.873411848
10:100007764-100009009(+)   0.274219271 0.377197434
10:100009146-100011362(+)   0.927057565 0.943862343
10:100011583-100011887(+)   0.883431739 0.902915706

Antwort1

verbinden+awkLösung:

join --header file1 file2 | awk 'NR>1{ $2=sprintf("%1.9f",$2); $3=sprintf("%.9f",$3) }1' > result.txt

cat result.txt
col1 file1col2 file2col2
10:100000525-100001560(+) 0.971465227 0.943385997
10:100001724-100002618(+) 0.940918504 0.981929023
10:100002725-100002970(+) 0.946592696 0.955549170
10:100003104-100004184(+) 0.736305487 0.736440827
10:100004450-100005051(+) 0.708230223 0.689045711
10:100005158-100005876(+) 0.969728923 0.964995338
10:100006075-100007551(+) 0.855411431 0.873411848
10:100007764-100009009(+) 0.274219271 0.377197434
10:100009146-100011362(+) 0.927057565 0.943862343
10:100011583-100011887(+) 0.883431739 0.902915706

Einzelheiten:

  • verbinden --headerOption - Behandeln Sie die erste Zeile in jeder Datei als Feldkopfzeile und drucken Sie sie, ohne zu versuchen, sie zu paaren

  • NR>1- Verarbeitung ab dem 2. Datensatz starten ( NR- Nummer des aktuellen Datensatzes), d. h. - überspringenHeaderLinie

  • sprintf("%1.9f",$2)- Argument $2(die 2. Spalte) als Float-Zahl mit 9 Dezimalstellen formatieren

verwandte Informationen