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Was ist die einfachste Möglichkeit, Dateigruppen zusammenzufassen?

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Was ist die einfachste Möglichkeit, Dateigruppen zusammenzufassen?

Ich habe Dateien mit einer Namenskonvention nach diesem Muster:

bond_7.LEU.CA.1.dat
bond_7.LEU.CA.2.dat
bond_7.LEU.CA.3.dat
bond_12.ALA.CB.1.dat
bond_12.ALA.CB.2.dat
bond_12.ALA.CB.3.dat
...

Ich möchte alle Dateien derselben Gruppe zu einer einzigen zusammenfassen. Beispiel:

cat bond_7.LEU.CA.*.dat > ../bondvalues/bond_7.LEU.CA.1_3.dat

Es gibt eine große Anzahl dieser Dateien. Wie kann dies mit einem Bash-Skript erreicht werden?

Antwort1

Vorausgesetzt, dass das von Ihnen angegebene Beispiel alle Ihre Dateien widerspiegelt, sollte Folgendes funktionieren:

for f in *.1.dat
do
  cat ${f%%1.dat}* > ${f%%1.dat}1_3.dat
done

Dies erfordert, dass jede Gruppe eine Datei mit der Erweiterung .1.dat enthält.

Antwort2

printf "%s\n" * | cut -d. -f1-3 | sort -u | while read prefix; do
  files=(${prefix}*)
  first=$(cut -d. -f4 <<< "${files[0]}")
  last=$(cut -d. -f4 <<< "${files[${#files[@]}-1]}")
  newfile=$(printf "../bondvalues/%s.%s_%s.dat" "$prefix" "$first" "$last")
  cat "${files[@]}" > "$newfile"
done

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