Hola, soy nuevo en Linux. Tengo dos archivos, uno tiene secuencia_id (archivo_1) y otro tiene secuencia_id con secuencia (archivo_1). Tengo que hacer si el id_secuencia (archivo_1) presente en el archivo_1 se almacenará en un archivo nuevo.
Ejemplo: Archivo_1
lcl|NW_002477239.1_gene_517
lcl|NW_002477243.1_gene_364
lcl|NW_002477248.1_gene_148
lcl|NW_002477249.1_gene_419
lcl|NW_002477249.1_gene_95
Archivo_2
>lcl|NW_002477253.1_gene_1
TGATGGAAGCTTCCAATTCTCCCGACCAACAATCAGTGCTCAGTGAATCTATCCTTGTTAGCGAGTCGCTTGTTCCA
>lcl|NW_002477239.1_gene_517
ATGGCTGATTTTGCAAAGGATCCTGCTCTCAACGCAGCATTATCTGCACCATGGGCGTTTCTCTGCCCTACATCAGAATTAAACGATACCATA
Rendimiento esperado:
>lcl|NW_002477239.1_gene_517
ATGGCTGATTTTGCAAAGGATCCTGCTCTCAACGCAGCATTATCTGCACCATGGGCGTTTCTCTGCCCTACATCAGAATTAAACGATACCATA
Por favor ayúdame a resolver este problema.
Respuesta1
Puede utilizar este script bash para obtener resultados con coincidencias
!#/bin/bash
while read line
do
grep $line File_2 >> file
done <./File_1