PyMOL tiene un complemento llamado herramienta APBS (http://www.pymolwiki.org/index.php/Apbsplugin) que requiere tres entradas de archivos diferentes:
- Binario APBS (apbs.exe)
- Archivo APBS psize.py
- Archivo PDB2PQR pdb2pqr.py
He instalado APBS y tengo apbs.exe y psize.py en mi directorio C:\APBS. PDB2PQR es el problema, lo he descargadohttp://sourceforge.net/projects/pdb2pqr/files/latest/download(versión 2.0.0 para Windows de 64 bits) extrajo su contenido y no pudo encontrar ningún archivo pdb2pqr.py en el directorio extraído. También intenté descargar el tarball pdb2pqr 1.8.0 (.tar.gz) y extraer su contenido, ya que me informaron en una lista de correo de usuarios de PyMOL que debería contener un archivo pdb2pqr.py y que puede ser más compatible con PyMOL. Pero este tarball es el código fuente y debe compilarse, lo cual, que yo sepa, no es posible en Windows 7.
Respuesta1
http://www.poissonboltzmann.org/
Este sería su método más productivo para obtener su respuesta con un chat en su sección de ayuda técnica y soporte. En cuanto a compilar en Windows 7, sí, es posible siempre que tenga el código fuente COMPLETO y el archivo de rutina de compilación.
Es posible que encuentre una falla en el software debido a que Windows 7 NO acepta controladores sin firmar, además de su instalación en el directorio raíz, lo cual es una mala idea ya que Win 7, 8 y demás tienen bloques para instalaciones de tipo heredado en el directorio raíz. .
Personalmente, consideraría hacer un cambio en la instalación y vería si puede instalarlo en el directorio principal de archivos de programa o en los archivos de programa x86 si es un software de 32 bits.
Es posible que considere necesario modificar las características de seguridad de las unidades para permitir que se realice la instalación. Lea las notas de Microsoft sobre esto antes de continuar y verifique cualquier codificación antes de compilar. Si se trata de un sistema basado en un servidor Linux/Unix, una instalación dual del servidor virtual Ubuntu puede resultarle útil.
Esta es información general ya que no tengo conocimiento del uso o del sistema de archivos sobre el que se refiere la pregunta y debe tomarse como un consejo. En caso de duda, hable con el fabricante y consiga ayuda siempre debe ser su primera opción.