Quiero ordenar mi archivo por la primera columna, pero tengo que comenzar a ordenar desde 5 caracteres. ¿Cómo puedo hacer eso?
Mi archivo:
"TTTTCTTACA" 1 1
"TTTTCTTACC" 1
"TTTTCTTACT" 1 1
"TTTTCTTAGC" 1
"TTTTCTTATT" 2
"TTTTCTTCAA" 1 1 1
"TTTTCTTCAG" 1 2 1
"TTTTCTTCAT" 1 2 2
"TTTTCTTCCT" 2
"TTTTCTTCGG" 2 2
"TTTTCTTCTA" 1
"TTTTCTTCTG" 1
"TTTTCTTCTT" 1 2
"TTTTCTTGAA" 1
"TTTTCTTGCT" 1 1 1
"TTTTCTTTAA" 1
"TTTTCTTTAG" 1 1
"TTTTCTTTCT" 1
"TTTTCTTTGC" 1
"TTTTCTTTGG" 1 1
"TTTTCTTTGT" 1 1 2 1
"TTTTCTTTTA" 1
Estaba intentando:
sort -k1,1 file | uniq -s 6 -w 5
Por supuesto, no funciona. Tal vez el tipo tenga algunas banderas, pero no las encontré. ¿Tienes alguna idea?
Respuesta1
tl; dr
sort -k1.5 file | uniq -s 6 -w 5
Explicación
Mi tipo es GNU coreutils 8.22. La página de manual para mi tipo muestra:
KEYDEF is F[.C][OPTS][,F[.C][OPTS]] for start and stop position, where F is a field number and C
a character position in the field; both are origin 1, and the stop position defaults to the
line's end.
Entonces, con su comando de clasificación actual, sort -k1,1 fileuse la primera palabra para la primera palabra como clasificación.
Lo que quieres es (para el comando de clasificación de todos modos):
sort -k1.5 file | uniq -s 6 -w 5
Esto utilizará el quinto carácter de la primera palabra, que es lo que querías.
Respuesta2
$ordenar -k2 archivo
"TTTTCTTCTA" 1
"TTTTCTTCCT" 2
"TTTTCTTACC" 1
"TTTTCTTATT" 2
"TTTTCTTCGG" 2 2
"TTTTCTTCTG" 1
"TTTTCTTGAA" 1
"TTTTCTTACA" 1 1
"TTTTCTTTAG" 1 1
"TTTTCTTTGG" 1 1
"TTTTCTTCAT" 1 2 2
"TTTTCTTAGC" 1
"TTTTCTTTAA" 1
"TTTTCTTTCT" 1
"TTTTCTTTGC" 1
"TTTTCTTTTA" 1
"TTTTCTTCTT" 1 2
"TTTTCTTCAA" 1 1 1
"TTTTCTTGCT" 1 1 1
"TTTTCTTCAG" 1 2 1
"TTTTCTTACT" 1 1
"TTTTCTTTGT" 1 1 2 1
$sort -k2 archivo | único -f 1
"TTTTCTTCTA" 1
"TTTTCTTCCT" 2
"TTTTCTTACC" 1
"TTTTCTTATT" 2
"TTTTCTTCGG" 2 2
"TTTTCTTCTG" 1
"TTTTCTTACA" 1 1
"TTTTCTTCAT" 1 2 2
"TTTTCTTAGC" 1
"TTTTCTTCTT" 1 2
"TTTTCTTCAA" 1 1 1
"TTTTCTTCAG" 1 2 1
"TTTTCTTACT" 1 1
"TTTTCTTTGT" 1 1 2 1