¿Cuáles son las posibles razones por las que el usuario root recibe "Permiso denegado" cuando intenta leer o escribir archivos?

¿Cuáles son las posibles razones por las que el usuario root recibe "Permiso denegado" cuando intenta leer o escribir archivos?

Estoy intentando actualizar una aplicación usando un paquete RPM, pero recibo el error:

cpio: failure to open file, Permission denied

El archivo que intenta abrir se encuentra /etc/rc.d/init.ddonde root tiene todos los permisos para el directorio, así como el archivo en sí. Ya intenté verificar si el archivo es inmutable, SELinux está en modo permisivo. No tengo ideas, entonces, ¿cuáles son otras razones por las que a root no se le permitiría acceder a los archivos?

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