Tengo Python 2.7 y 3.5 instalados en Debian Stretch en mi plataforma Linux de 64 bits.
He instalado PyChem (http://pychem.sourceforge.net/), escrito en Python2 después de convertir los archivos de Python usando el script 2to3. No hubo mensajes de advertencia o error durante el proceso de conversión.
La instalación puso los archivos /usr/local/lib/python2.7/dist-packages/pychem(con pychem-1.0.egg-infoin /usr/local/lib/python2.7/dist-packages).
Para probar la aplicación probé:
# -*- coding: utf-8 -*-
"""
Spyder Editor
This is a temporary script file.
"""
from pychem import pychem
from pychem.pychem import Chem
mol=Chem.MolFromSmiles("CC(oc1ccccC(O)=O)=O"
Esto generó el mensaje de error No module named 'pychem'.
Desafortunadamente, para mí, el problema va más allá del conocimiento muy limitado de computadoras que poseo como químico orgánico. Se agradecerán mucho las sugerencias sobre una solución al problema.