Eliminar líneas con el primer campo/columna repetido de un archivo grande

Eliminar líneas con el primer campo/columna repetido de un archivo grande

Tengo un archivo muy grande (fragmento a continuación). Necesito eliminar cualquier línea donde el número de la primera columna no aumente consecutivamente desde la línea anterior.

Por ejemplo, quiero conservar la primera línea de mi fragmento, donde el identificador en la primera columna es " 40812." Luego quiero conservar la fila donde " 40813" está en la primera columna (línea 3 en mi ejemplo) y luego la fila que comienza con " 40814", y así sucesivamente. Quiero eliminar cualquier línea que viole esta sucesión, como la segunda fila.

He buscado aquí preguntas/respuestas anteriores en busca de posibles soluciones y hasta ahora no he tenido éxito. Una solución que ha aparecido en varias preguntas es:

awk -F',' ' '!seen[$1]++ myFile

Adapté otra solución que vi como:

sort -t':' -k 1,1 -u myFile

Si alguien pudiera decirme en qué me estoy equivocando, se lo agradecería mucho. No tengo mucha experiencia con la manipulación de archivos.

 40812        20406.000000         0.843859468      1083.209050130      -994.562279080      -993.349611938        22.120868921
 40829        20414.500000         0.891283743      1144.084593627      -994.539001565      -993.349739827        21.177788019
 40813        20406.500000         0.829362077      1064.599666089      -994.546948121      -993.348764740        22.087239027
 40830        20415.000000         0.889606427      1141.931529727      -994.537943593      -993.350242614        21.282490969
 40814        20407.000000         0.822524589      1055.822814442      -994.540118434      -993.348757318        22.083606005
 40831        20415.500000         0.875230513      1123.478077086      -994.523844766      -993.350421831        20.606467962
 40815        20407.500000         0.823511602      1057.089780943      -994.541681744      -993.349315083        22.432111979
 40832        20416.000000         0.846150258      1086.149592126      -994.494220141      -993.349798791        22.309054136
 40816        20408.000000         0.824550451      1058.423286012      -994.543159511      -993.349731194        22.481428146
 40833        20416.500000         0.811604775      1041.805740021      -994.458563132      -993.348626225        21.118428946
 40834        20417.000000         0.787796672      1011.244783236      -994.434062658      -993.347887110        20.963790894
 40817        20408.500000         0.819160081      1051.504008955      -994.537767061      -993.349702160        22.268819809
 40835        20417.500000         0.784857495      1007.471947645      -994.431441227      -993.348167742        20.731789112
 40818        20409.000000         0.807571275      1036.628191427      -994.525675417      -993.349169067        22.332761049
 40836        20418.000000         0.799208319      1025.893192994      -994.446595759      -993.348938468        21.268665075
 40819        20409.500000         0.797104599      1023.192780242      -994.514563564      -993.348491176        22.622548103
 40837        20418.500000         0.819797939      1052.322786256      -994.467698852      -993.349417295        21.013041973
 40820        20410.000000         0.796605925      1022.552664951      -994.513928312      -993.348319789        22.193170071

Respuesta1

Este es exactamente el tipo de cosas en las que awksobresale:

$ awk '{ if(NR==1 || $1 == last+1){print; last=$1}}' file
 40812        20406.000000         0.843859468      1083.209050130      -994.562279080      -993.349611938        22.120868921
 40813        20406.500000         0.829362077      1064.599666089      -994.546948121      -993.348764740        22.087239027
 40814        20407.000000         0.822524589      1055.822814442      -994.540118434      -993.348757318        22.083606005
 40815        20407.500000         0.823511602      1057.089780943      -994.541681744      -993.349315083        22.432111979
 40816        20408.000000         0.824550451      1058.423286012      -994.543159511      -993.349731194        22.481428146
 40817        20408.500000         0.819160081      1051.504008955      -994.537767061      -993.349702160        22.268819809
 40818        20409.000000         0.807571275      1036.628191427      -994.525675417      -993.349169067        22.332761049
 40819        20409.500000         0.797104599      1023.192780242      -994.514563564      -993.348491176        22.622548103
 40820        20410.000000         0.796605925      1022.552664951      -994.513928312      -993.348319789        22.193170071

O jugar un poco al golf:

$ awk '(NR==1 || $1 == last+1) && last=$1' file
 40812        20406.000000         0.843859468      1083.209050130      -994.562279080      -993.349611938        22.120868921
 40813        20406.500000         0.829362077      1064.599666089      -994.546948121      -993.348764740        22.087239027
 40814        20407.000000         0.822524589      1055.822814442      -994.540118434      -993.348757318        22.083606005
 40815        20407.500000         0.823511602      1057.089780943      -994.541681744      -993.349315083        22.432111979
 40816        20408.000000         0.824550451      1058.423286012      -994.543159511      -993.349731194        22.481428146
 40817        20408.500000         0.819160081      1051.504008955      -994.537767061      -993.349702160        22.268819809
 40818        20409.000000         0.807571275      1036.628191427      -994.525675417      -993.349169067        22.332761049
 40819        20409.500000         0.797104599      1023.192780242      -994.514563564      -993.348491176        22.622548103
 40820        20410.000000         0.796605925      1022.552664951      -994.513928312      -993.348319789        22.193170071

Explicación

  • if(NR==1 || $1 == last+1): NRes el número de línea actual. Por lo tanto, NR == 1solo será cierto al leer la primera línea del archivo. Necesitamos esto para que siempre imprimamos la primera línea. Entonces, $1 == last +1será verdadero si el primer campo de la línea ( $1) es igual al valor almacenado en la variable lastmás 1. En conjunto, esto significa "si esta es la última línea o si el primer campo es igual al último + 1", lo cual define sus líneas de destino.
  • print; last=$1: Si cualquiera de las dos condiciones explicadas anteriormente es verdadera, imprima la línea y establezca el valor de lastpara que sea el primer campo deestelínea para que podamos procesar la siguiente.

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