ordenar reemplazando valores de columna con NA

ordenar reemplazando valores de columna con NA

He estado intentando ordenar este archivo, sigo apareciendo NA en mi primera columna y no sé por qué.

> head Coch_ATAC_peaks.bed
chr1    3181385 3181783
chr1    3389977 3390375
chr1    3456575 3456973
chr1    3661505 3661903
chr1    3903684 3904082
chr1    3916303 3916701
chr1    4316903 4317301
chr1    4322506 4322904
chr1    4402488 4402886
chr1    4416984 4417382

> sort -k 1,1V Coch_ATAC_peaks.bed | head
NA      1050187 1050585
NA      110317  110715
NA      127371  127769
NA      128207  128605
NA      13412   13810
NA      159542  159940
NA      193109  193507
NA      223382  223780
NA      233951  234349
NA      252365  252763

Originalmente hice este archivo en una PC con Windows. Lo convertí a UNIX con dos2unix. ¿Alguna idea de dónde vienen estas NA?

Respuesta1

Ver el comentario de αғsнιη. Esperaba que las NA se crearan por ordenación; sin embargo, estuvieron presentes en el expediente todo el tiempo.

> grep NA Coch_ATAC_peaks.bed
NA      2745    3143
NA      5650    6048
NA      9679    10077
NA      13412   13810
NA      39048   39446
NA      43021   43419
NA      55564   55962
NA      69578   69976
NA      110317  110715
NA      127371  127769

Una vez que se eliminaron las NA, > sort -k 1,1 Coch_ATAC_peaks.bed las obras en sentido ascendente se realizaron según lo previsto.

información relacionada