¿Cómo puedo guardar imágenes NIfTI separadas en directorios según el nombre del protocolo?

Question

En la página de GitHubdcm2nii Convertidor DICOM a NIfTI (README):

… es posible que desee invocar opciones adicionales, por ejemplo, la llamada dcm2niix -z y -f %p_%t_%s -o /path/output /path/to/dicom/folder guardará los datos comprimidos con gzip, con el nombre del archivo basado en el nombre del protocolo (%p), el tiempo de adquisición (%t) y el número de serie DICOM (%s), con todos los archivos. guardado en la carpeta "salida". …

¿Existe algún comando que le permita guardar imágenes en carpetas separadas según el nombre del protocolo?