¿Hay alguna manera de permitir que la búsqueda de PDF encuentre palabras con ligaduras? Yo uso XeLaTeX.
\documentclass{book}
\begin{document}
Prefix.
\end{document}
En el archivo pdf resultante, falla la búsqueda de la palabra "Prefijo".
Respuesta1
Agregar\usepackage{fontspec} . esto en realidadcarga el paquetefontenc, lo que resolvería su problema con pdfLaTeX.
Como resultado, se cargan las fuentes ec en lugar de las fuentes estándar Computer Modern, como comentó Ulrike en los comentarios. Para otras fuentes, podrían aplicarse otras soluciones; esta respuesta aborda una configuración estándar como se ve en el MWE del OP.