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Reemplace las celdas vacías con NaN en pgfplotstable

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Reemplace las celdas vacías con NaN en pgfplotstable

Necesito trazar el contenido de un archivo csv. La tabla en el archivo contiene varias celdas vacías que deben reemplazarse por NaN para que, al trazar los datos con la unbounded coords=jumpopción, se interrumpa el trazado en las posiciones de los valores faltantes.

Pensé en usar la empty cells withclave, pero no funciona como se esperaba. En el siguiente ejemplo, la primera tabla contiene celdas vacías que se reemplazan automáticamente por NaN y no funciona; la segunda tabla ya contiene celdas NaN y funciona correctamente.

\documentclass{article}
\usepackage{pgfplotstable}
\pgfplotsset{compat=1.14}
\usepgfplotslibrary{groupplots}
\usepackage{filecontents}

% the next table won't work properly
\begin{filecontents}{testtablea.csv}
a;b
0;0
1;1
2;2
3;2
4;2
5;2
6;
7;
8;2
9;1
10;0
\end{filecontents}

% this will work instead
\begin{filecontents}{testtableb.csv}
a;b
0;0
1;1
2;2
3;2
4;2
5;2
6;NaN
7;NaN
8;2
9;1
10;0
\end{filecontents}

\pgfplotstableset{empty cells with={NaN}}
\pgfplotstableread[col sep=semicolon]{testtable1.csv}\testtablea
\pgfplotstableread[col sep=semicolon]{testtable2.csv}\testtableb
\begin{document}
\centering
\pgfplotstabletypeset{\testtablea}\hspace{3cm}
\pgfplotstabletypeset{\testtableb}

\begin{tikzpicture}
\begin{axis} [title=automatic replacement, anchor=north east, width=7cm]
\addplot+ [unbounded coords=jump] table {\testtablea};
\end{axis}
\hspace{1cm}

\begin{axis} [title=well defined table, anchor=north west, width=7cm]
\addplot+ [unbounded coords=jump] table {\testtableb};
\end{axis}
\end{tikzpicture}
\end{document}

comportamiento incorrecto y correcto

Entonces la pregunta es:

1) ¿Cómo puedo reemplazar las celdas vacías en el archivo csv original para pgfplotstablealcanzar mi objetivo?

o

2) ¿Cómo puedo omitir directamente los valores vacíos en a pgfplot(es decir, sin pgfplotstable)?

Respuesta1

Con el paquete ifthenpuedes agregar

y filter/.code={\ifthenelse{\equal{#1}{}}{\def\pgfmathresult{nan}}{}}

como opción de trazado u opción de eje.

ingrese la descripción de la imagen aquí

Código:

\documentclass{article}
\usepackage{pgfplotstable}
\pgfplotsset{compat=1.14}
\usepackage{ifthen}% <- added
% the next table won't work properly
\begin{filecontents}{testtablea.csv}
a;b
0;0
1;1
2;2
3;2
4;2
5;2
6;
7;
8;2
9;1
10;0
\end{filecontents}

% this will work instead
\begin{filecontents}{testtableb.csv}
a;b
0;0
1;1
2;2
3;2
4;2
5;2
6;NaN
7;NaN
8;2
9;1
10;0
\end{filecontents}

\pgfplotstableset{empty cells with={NaN}}
\pgfplotstableread[col sep=semicolon]{testtablea.csv}\testtablea
\pgfplotstableread[col sep=semicolon]{testtableb.csv}\testtableb
\begin{document}
\centering
\pgfplotstabletypeset{\testtablea}\hspace{3cm}
\pgfplotstabletypeset{\testtableb}

\begin{tikzpicture}
\begin{axis} [title=automatic replacement, anchor=north east, width=7cm]
\addplot+[
  y filter/.code={\ifthenelse{\equal{#1}{}}{\def\pgfmathresult{nan}}{}},% <- added
  unbounded coords=jump
]  table {\testtablea};
\end{axis}
\hspace{1cm}
\begin{axis} [title=well defined table, anchor=north west, width=7cm]
\addplot+ [unbounded coords=jump] table {\testtableb};
\end{axis}
\end{tikzpicture}
\end{document}

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