\documentclass{article}
\begin{document}
\begin{center}
\begin{tabular}{|c|c|c|c|}
\hline
Type of Variation & C& B\\
\hline \hline
SNP &
\begin{center}
\begin{tabular}[t]{cccc}
\centering
1&2&3&4\\ A&C&G&T\\ A&T&G&T
\end{tabular}
\end{center}\\ &&
\begin{center}
\begin{tabular}[t]{ccc}
POS & REF & ALT\\
2 & C & T \\
\end{tabular}
\end{center}\\ \hline
\end{tabular}
\end{center}
\end{table}
\end{document}
Respuesta1
Sospecho que lo siguiente puede ser lo que estás buscando. Observe que center
se han eliminado todos los entornos, \centering
se proporciona una única instrucción inmediatamente delante del tabular
entorno más externo, \begin{table}
se proporciona la instrucción que falta y el número de columnas en el tabular
entorno exterior se reduce de 4 a 3.
\documentclass{article}
\usepackage{array} % for "\extrarowheight" macro
\usepackage[skip=0.333\baselineskip]{caption}
\begin{document}
\begin{table}
\setlength\extrarowheight{2pt} % for a slightly more open "look"
\centering
\caption{Nested \texttt{tabular} environments}
\begin{tabular}{|c|c|c|}
\hline
Type of Variation & C & B \\
\hline \hline
SNP &
\begin{tabular}[t]{@{}cccc@{}} % "@{}" omits side padding
1&2&3&4 \\
A&C&G&T \\
A&T&G&T \\
\end{tabular} &
\begin{tabular}[t]{@{}ccc@{}}
POS & REF & ALT\\
2 & C & T \\
\end{tabular} \\
\hline
\end{tabular}
\end{table}
\end{document}