Estoy escribiendo un informe con látex pero \printbibliographyda Undefined control sequenceerror. Este es un extracto de mi archivo .tex:
\documentclass[]{article}
\usepackage[backend=biber, sorting=none, maxnames=35]{biblatex}
\addbibresource{report.bib}
\title{Title}
\begin{document}
\maketitle
Report content \cite{hkust}\cite{hkust_cat}\cite{geom}\cite{dreiding}\cite{cp2k}\cite{charmm}\cite{Smit}\cite{csd1}\cite{csd2}.
\printbibliography
\end{document}
Y este es mi archivo .bib:
@article{Smit,
author = {Boyd, Peter G. and Moosavi, Seyed Mohamad and Witman, Matthew and Smit, Berend},
title = {Force-Field Prediction of Materials Properties in Metal-Organic Frameworks},
journal = {The Journal of Physical Chemistry Letters},
volume = {8},
number = {2},
pages = {357-363},
year = {2017},
doi = {10.1021/acs.jpclett.6b02532}
}
@article{dreiding,
author = {Mayo, Stephen L. and Olafson, Barry D. and Goddard, William A.},
title = {DREIDING: a generic force field for molecular simulations},
journal = {The Journal of Physical Chemistry},
volume = {94},
number = {26},
pages = {8897-8909},
year = {1990},
doi = {10.1021/j100389a010}
}
@article {hkust,
author = {Chui, Stephen S.-Y. and Lo, Samuel M.-F. and Charmant, Jonathan P. H. and Orpen, A. Guy and Williams, Ian D.},
title = {A Chemically Functionalizable Nanoporous Material [Cu$_3$(TMA)$_2$(H$_2$O)$_3$]$_n$},
journal = {Science},
volume = {283},
number = {5405},
pages = {1148--1150},
year = {1999},
doi = {10.1126/science.283.5405.1148}
}
@article{charmm,
author = {MacKerell, A. D. and Bashford, D. and Bellott, M. and Dunbrack, R. L. and Evanseck, J. D. and Field, M. J. and Fischer, S. and Gao, J. and Guo, H. and Ha, S. and Joseph-McCarthy, D. and Kuchnir, L. and Kuczera, K. and Lau, F. T. K. and Mattos, C. and Michnick, S. and Ngo, T. and Nguyen, D. T. and Prodhom, B. and Reiher, W. E. and Roux, B. and Schlenkrich, M. and Smith, J. C. and Stote, R. and Straub, J. and Watanabe, M. and Wi{\'o}rkiewicz-Kuczera, J. and Yin, D. and Karplus, M.},
title = {All-Atom Empirical Potential for Molecular Modeling and Dynamics Studies of Proteins},
journal = {The Journal of Physical Chemistry B},
volume = {102},
number = {18},
pages = {3586-3616},
year = {1998},
doi = {10.1021/jp973084f}
}
@article{cp2k,
title={cp2k: atomistic simulations of condensed matter systems},
author={Hutter, J{\"u}rg and Iannuzzi, Marcella and Schiffmann, Florian and VandeVondele, Joost},
journal={Wiley Interdisciplinary Reviews: Computational Molecular Science},
volume={4},
number={1},
pages={15--25},
year={2014}
}
@article{lammps,
title={Fast Parallel Algorithms for Short-Range Molecular Dynamics},
author={Steve Plimpton},
journal={The Journal of Computational Physics},
volume={117},
number={1},
pages={1-19},
year={1995}
}
@article{lbfgs,
title={On the Limited Memory BFGS Method for Large Scale Optimization},
author={Dong C., Liu and Jorge, Nocedal},
journal={The Journal Mathematical Programming},
volume={45},
number={},
pages={503-528},
year={1989},
doi={10.1007/BF01589116}
}
@article{fire,
title = {Structural Relaxation Made Simple},
author = {Bitzek, Erik and Koskinen, Pekka and G{\"a}hler, Franz and Moseler, Michael and Gumbsch, Peter},
journal = {Physical Review Letters},
volume = {97},
issue = {17},
pages = {170201-170205},
numpages = {},
year = {2006},
month = {},
publisher = {},
doi = {10.1103/PhysRevLett.97.170201}
}
@article{hkust_cat,
author = {Alaerts, Luc and S{\'e}guin, Etienne and Poelman, Hilde and Thibault-Starzyk, Fr{\'e}d{\'e}ric and Jacobs, Pierre A. and De Vos, Dirk E.},
title = {Probing the Lewis Acidity and Catalytic Activity of the Metal-Organic Framework [Cu$_3$(btc)$_2$]},
journal = {Chemistry: A European Journal},
volume = {12},
number = {28},
year = {2006},
pages = {7353-7363},
doi = {10.1002/chem.200600220}
}
@article {Murnaghan,
author = {Murnaghan, Francis D.},
title = {The Compressibility of Media under Extreme Pressures},
volume = {30},
number = {9},
pages = {244--247},
year = {1944},
doi = {10.1073/pnas.30.9.244},
journal = {Proceedings of the National Academy of Sciences}
}
@article{geom,
author = {Prestipino, C. and Regli, L. and Vitillo, J. G. and Bonino, F. and Damin, A. and Lamberti, C. and Zecchina, A. and Solari, P. L. and Kongshaug, K. O. and Bordiga, S.},
title = {Local Structure of Framework Cu(II) in HKUST-1 Metallorganic Framework: Spectroscopic Characterization upon Activation and Interaction with Adsorbates},
journal = {Chemistry of Materials},
volume = {18},
number = {5},
pages = {1337-1346},
year = {2006},
doi = {10.1021/cm052191g},
}
@article{csd1,
author = {Allen, Frank H.},
title = "{The Cambridge Structural Database: a quarter of a million crystal structures and rising}",
journal = {Acta Crystallographica Section B},
year = {2002},
volume = {58},
pages = {380--388},
doi = {10.1107/S0108768102003890},
}
@article{csd2,
author = {Groom, Colin R. and Allen, Frank H.},
title = {The Cambridge Structural Database in Retrospect and Prospect},
journal = {Angewandte Chemie International Edition},
volume = {53},
number = {3},
pages = {662-671},
doi = {10.1002/anie.201306438},
year = {2014},
}
Cuando ejecuto el archivo .bib dice:
ADVERTENCIA: la entrada 'charmm' tiene caracteres que no se pueden codificar en 'ascii'. Recodificar caracteres problemáticos en macros.
Pero creo que resolví este problema escribiendo los caracteres que no están en inglés entre llaves.
Otro problema es que cuando compilo el informe, imprime algo extraño como \geomreferencia. Aquí está la página de referencias. Consultar referencia 3.
No sé cómo solucionar este problema. Revisé las otras preguntas aquí pero ninguna fue útil. Se agradece cualquier ayuda.
Respuesta1
Cuando ejecuto MWE en un sistema LaTeX moderno (más reciente que abril de 2018), LaTeX se queja
! Package inputenc Error: Unicode character (U+2009)
(inputenc) not set up for use with LaTeX.
Y, de hecho, copiar y pegar su .bibarchivo enhttps://w3c.github.io/xml-entities/unicode-names.htmly busque U+2009 en el resultado muestra que el título de la entradageom
title = {Local Structure of Framework Cu(II) in HKUST-1 Metallorganic Framework: Spectroscopic Characterization upon Activation and Interaction with Adsorbates},
tiene un espacio delgado (U+2009) después de los dos puntos en lugar de un espacio normal.
Se podría decirle a LaTeX qué hacer con U+2009 agregando
\DeclareUnicodeCharacter{2009}{\thinspace}
al preámbulo. Pero creo que en este caso un espacio reducido no es apropiado.
Te sugiero que reemplaces el espacio delgado con un espacio normal.
El mensaje
WARN - The entry 'charmm' has characters which cannot be encoded in 'ascii'. Recoding problematic characters into macros.
sugiere que es posible que esté utilizando un sistema LaTeX más antiguo (anterior a abril de 2018), donde ASCII sigue siendo la codificación estándar y no UTF-8. En ese caso, Biber intenta convertir caracteres que no son ASCII a sus homólogos de LaTeX, pero aparentemente no logra hacer algo sensato para U+2009.
En este caso, la única manera de que todo vuelva a funcionar rápidamente es reemplazando el espacio delgado por uno normal.
En cuanto a las otras advertencias de caracteres no ASCII que recibe, no se solucionan exactamente agregando más llaves.
Le sugiero que codifique tanto su .texdocumento como su .bibarchivo en UTF-8 y se lo informe a LaTeX cargándolo \usepackage[utf8]{inputenc}(ese último bit ya no es necesario en las versiones más recientes de LaTeX, porque UTF-8 es el valor predeterminado).
En general esnoEs mejor que Biber ingrese Wiórkiewicz-Kuczeracomo Wi{\'o}rkiewicz-Kuczera( charmm) siempre que le indique a Biber qué codificación va a utilizar. Prefiero los caracteres Unicode aquí si es posible porque eso evita un par de llaves innecesarias (que podrían destruir el kerning). Lo mismo se aplica a J{\"u}rg/ Jürg( cp2k) y S{\'e}guin/Séguin( hkust_cat).
Quizás también quieras echarle un vistazo al título dehkust
title = {A Chemically Functionalizable Nanoporous Material [Cu$_3$(TMA)$_2$(H$_2$O)$_3$]$_n$},
Parece un leve abuso del modo matemático. Hay paquetes dedicados comomhchemychemmacrosque le permiten escribir fórmulas químicas sin tener que ir y venir entre el modo texto y matemático.