Alto uso de CPU, baja espera de IO y bajo tiempo de inactividad con solo 2 procesos en ejecución. ¿Cómo identifico el proceso y el script que está causando esto?

Alto uso de CPU, baja espera de IO y bajo tiempo de inactividad con solo 2 procesos en ejecución. ¿Cómo identifico el proceso y el script que está causando esto?
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Los estoy ejecutando, pero no estoy seguro de cómo estar 100% seguro de qué está causando el problema. Hice top y vi que el tiempo de inactividad era bajo y la espera de E/S era alta y el tiempo de usuario de la CPU era alto. Creo que el culpable es un proceso rsync, pero el proceso superior siempre me muestra que el proceso mysqld es el proceso que usa el la mayoría de las CPU. Así que no estoy seguro de cómo comprobarlo, intenté MOSTRAR LISTA DE PROCESOS COMPLETA, pero no me muestra nada particularmente extraño y no me dice que hay un rsync, al menos no veo ninguna consulta SQL, tal vez Lo perdí, lo que significa que ya había desaparecido cuando lo ejecuté. Hay muchos procesos de sueño. 603 y sólo 2 no duermen. El porcentaje que usa el proceso mysqld es 695% en términos de CPU, y los otros procesos debajo de él usan aproximadamente entre 20% y 10% y son procesos php-fpm, redis y php. Entonces, ¿cómo sé si debo actualizar o no? Creo que necesitamos actualizar, pero no estoy seguro de cómo verificar el motivo exacto.

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