Estoy calculando simulaciones de Monte-Carlo usando GNU Octave 4.0.0 en mi PC de 4 núcleos. La simulación tarda casi 4 horas en calcular el script 50.000 veces (específico de mi problema), lo que supone una gran cantidad de tiempo dedicado al cálculo. Me preguntaba si hay alguna manera de ejecutar Octave en varios núcleos simultáneamente para reducir el tiempo de cálculo.
Gracias de antemano.
Respuesta1
GNU Parallel no realizará subprocesos múltiples, perovoluntadhaz multiprocesamiento, lo que podría ser suficiente para ti:
seq 50000 | parallel my_MC_sim --iteration {}
De forma predeterminada, habrá 1 proceso por núcleo de CPU y se asegurará de que la salida de dos trabajos paralelos no se mezcle.
Incluso puedes poner esta paralelización en el script Octave. Verhttps://www.gnu.org/software/parallel/parallel_tutorial.html#Shebang
GNU Parallel es un paralelizador general y facilita la ejecución de trabajos en paralelo en la misma máquina o en varias máquinas a las que tiene acceso ssh. A menudo puede reemplazar un forbucle.
Si tiene 32 trabajos diferentes que desea ejecutar en 4 CPU, una forma sencilla de paralelizar es ejecutar 8 trabajos en cada CPU:
En cambio, GNU Parallel genera un nuevo proceso cuando uno finaliza, manteniendo las CPU activas y, por lo tanto, ahorrando tiempo:
Instalación
Si GNU Parallel no está empaquetado para su distribución, puede realizar una instalación personal, que no requiere acceso de root. Se puede hacer en 10 segundos haciendo esto:
(wget -O - pi.dk/3 || curl pi.dk/3/ || fetch -o - http://pi.dk/3) | bash
Para otras opciones de instalación consultehttp://git.savannah.gnu.org/cgit/parallel.git/tree/README
Aprende más
Ver más ejemplos:http://www.gnu.org/software/parallel/man.html
Mira los vídeos de introducción:https://www.youtube.com/playlist?list=PL284C9FF2488BC6D1
Sigue el tutorial:http://www.gnu.org/software/parallel/parallel_tutorial.html
Regístrese en la lista de correo electrónico para obtener ayuda:https://lists.gnu.org/mailman/listinfo/parallel