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대용량 파일을 고유한 파일로 분할

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대용량 파일을 고유한 파일로 분할

나는 텍스트(아래 몇 줄)가 있는 100M의 거대한 파일을 가지고 있습니다. 줄의 스택은 고유 합니다 scaffold1_.scaffold2_

각 scaffold.1...txt에 특정한 새 파일을 갖고 싶습니다. 몇 가지 명령을 시도했지만 sed도움 grep이 되지 않았습니다.

scaffold1_2,C,C,C,C,N,C,N,C,G,G,C,N,C,C,G,N,N,C,G,N,C,C,C,G,C,N,N,C,C
scaffold1_113,T,T,T,T,T,T,T,T,T,C,T,T,T,T,T,T,C,T,T,T,T,T,C,T,T,N,T,T,T
scaffold1_149,G,G,G,G,C,G,C,G,C,G,G,C,C,G,C,C,G,C,G,G,C,G,G,G,G,C,G,G,G
scaffold1_160,G,G,G,T,G,T,T,T,N,T,T,T,G,T,G,G,T,T,T,T,T,N,T,T,G,G,T,T,G
scaffold2_315,C,C,C,G,C,C,C,C,C,C,C,G,C,C,G,G,G,C,C,C,C,C,C,G,C,C,C,C,G
scaffold2_318,G,A,A,A,A,A,A,G,A,A,A,A,A,A,A,A,A,A,G,A,A,A,A,A,A,A,A,A,A
scaffold2_323,T,T,T,T,T,C,C,T,T,T,T,T,T,T,T,T,T,T,T,C,T,T,T,T,T,T,T,T,T
scaffold2_397,A,A,A,A,A,A,C,A,A,A,A,A,A,A,A,A,C,A,A,A,A,A,A,A,A,A,A,A,A
scaffold3_402,C,C,C,C,C,T,C,C,C,C,C,C,C,T,C,C,C,T,C,C,C,C,C,C,C,C,C,C,C
scaffold3_465,G,G,G,G,G,G,G,G,G,C,G,G,G,G,G,G,G,G,G,G,G,G,G,G,G,G,C,C,G
scaffold3_502,C,C,C,C,C,C,C,C,C,G,C,C,C,C,C,C,C,G,C,G,C,G,C,C,C,C,C,C,C
scaffold3_508,G,G,G,C,G,G,G,G,G,C,G,C,C,C,C,C,G,C,G,C,G,C,C,C,C,C,C,C,C
scaffold3_533,G,G,G,G,A,A,A,G,A,G,A,G,G,A,G,G,A,A,G,A,A,G,G,G,G,G,G,G,G
scaffold4_555,T,T,T,T,T,T,T,T,T,T,T,T,T,T,A,A,T,T,T,T,T,T,T,T,T,T,T,T,T
scaffold4_586,T,T,T,T,T,T,T,T,T,T,T,C,C,T,T,T,T,T,T,T,T,T,C,T,C,T,T,T,T
scaffold4_593,A,G,G,G,A,A,A,A,G,G,A,A,A,A,G,G,A,A,G,A,G,G,A,G,A,G,A,A,G
scaffold4_598,C,C,C,C,C,C,C,C,C,C,C,C,C,C,C,C,C,C,C,C,C,C,C,C,C,C,A,A,C
scaffold4_664,G,A,A,G,G,G,A,G,G,G,G,G,G,G,G,G,A,G,G,G,G,G,G,G,G,G,G,G,G
scaffold5_667,C,C,C,C,C,C,C,C,T,C,C,C,C,C,C,C,C,C,T,C,T,T,C,C,C,C,T,T,C
scaffold5_670,A,A,A,A,A,A,A,A,G,A,A,A,A,A,A,A,A,A,G,A,G,G,A,A,A,A,G,G,A
scaffold5_679,T,C,C,C,C,C,C,T,C,T,C,C,C,C,C,C,C,C,C,C,C,C,C,C,C,C,C,C,C

결과 파일은 다음과 같아야 합니다.

고양이 비계1.txt
scaffold1_2,C,C,C,C,N,C,N,C,G,G,C,N,C,C,G,N,N,C,G,N,C,C,C,G,C,N,N,C,C
scaffold1_113,T,T,T,T,T,T,T,T,T,C,T,T,T,T,T,T,C,T,T,T,T,T,C,T,T,N,T,T,T
scaffold1_149,G,G,G,G,C,G,C,G,C,G,G,C,C,G,C,C,G,C,G,G,C,G,G,G,G,C,G,G,G
scaffold1_160,G,G,G,T,G,T,T,T,N,T,T,T,G,T,G,G,T,T,T,T,T,N,T,T,G,G,T,T,G

고양이 비계2.txt
scaffold2_315,C,C,C,G,C,C,C,C,C,C,C,G,C,C,G,G,G,C,C,C,C,C,C,G,C,C,C,C,G
scaffold2_318,G,A,A,A,A,A,A,G,A,A,A,A,A,A,A,A,A,A,G,A,A,A,A,A,A,A,A,A,A
scaffold2_323,T,T,T,T,T,C,C,T,T,T,T,T,T,T,T,T,T,T,T,C,T,T,T,T,T,T,T,T,T
scaffold2_397,A,A,A,A,A,A,C,A,A,A,A,A,A,A,A,A,C,A,A,A,A,A,A,A,A,A,A,A,A

답변1

for i in $(cat myfile.txt|cut -d"_" -f 1 | sort | uniq)
do
  grep ${i} myfile.txt > ${i}.txt
done

이것은 작동합니다

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