Normalmente trabalho com versões live do Ubuntu. Eu tenho um NAS que uso para salvar arquivos de computadores. Quando salvo arquivos no NAS tudo funciona bem, mas quando tento recuperar arquivos do NAS para o computador tudo dá errado. Usando Ubuntu 9.04 e 9.10 ele funciona corretamente, mas a partir de 10.04 ele para de funcionar e você não consegue pegar os arquivos do NAS.
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Meu palpite, com base nas poucas informações da sua postagem, é que se trata de um problema de permissão. Se você estiver usando o NFS para acessar o NAS do Ubuntu, as permissões serão gerenciadas usando identificadores numéricos de usuário. O NAS os rastreia, o cliente (seu desktop) traduz os números em nomes de usuário. Provavelmente, entre as diferentes versões, o nome de usuário que você está usando recebeu um UID diferente. Provavelmente, costumava ser 1000, agora é 1001. (A menos que executar um live CD signifique que você está root o tempo todo?)
Como primeira etapa para a depuração, como você está acessando o NAS e pode resolver um ls -ldos arquivos problemáticos? (Tudo o que queremos são as colunas da esquerda, não os nomes dos arquivos)