Ontem à noite tentei instalar o Ubuntu no meu disco rígido secundário e inicializar duas vezes o Windows 10. Ele estragou tudo completamente. Grub me ferrou. Acho que minha comida ainda está bagunçada e preciso consertá-la. Como eu instalaria o Ubuntu 15.04 em um disco rígido interno secundário e ainda seria capaz de inicializar o Windows, se necessário, na inicialização. Antes do Windows 8 isso era fácil, mas com a maneira como a Microsoft mudou tudo, isso me deu um tiro no pé. Estou instalando o live iso no meu usb pelo UNetbootin. Sim, tenho UEFI, infelizmente.
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O Ubuntu deve ser instalado após o Windows, porque o Windows limpa intencionalmente qualquer outro gerenciador de inicialização que não seja o seu. Mesmo que você instale o Ubuntu em um segundo disco rígido, o bootloader deve ser instalado no disco rígido mestre.
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Não tenho a solução exata que você está procurando, mas meu computador está configurado para inicializar diretamente no Ubuntu, mas quando preciso do Windows, clico em f12 e seleciono a outra unidade, o que significa menos confusão com o GRUB. Poderia algo assim funcionar?