Novo no Linux. Estou executando o XUbuntu 14.04 em uma VM. Não há problema antes da atualização, mas após a atualização por meio do atualizador de software e reinicialização, isso acontece:
A área direita da tela não é clicável, mas tudo o que eu abro na parte esquerda aparece novamente à direita. Outra coisa que notei é que durante a inicialização, aparece uma tela cinza por alguns segundos, mas a área de trabalho aparece. Pude ver várias perguntas sobre tela cinza, mas não tenho certeza se alguma delas é relevante para isso.
Informe se esse é um problema conhecido e se há alguma maneira de reverter para a área de trabalho original antes da atualização. (e pedimos desculpas antecipadamente se esta pergunta já foi feita)
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Aconteceu comigo também no Xubuntu 14.04 LTS e no Lubuntu 14.04 LTS rodando no VMware player 3.1.4 build-385536. Parece um problema de kernel que ainda não foi resolvido.
Resolvi o problema fazendo o downgrade do kernel. Verifique a versão do kernel (no meu caso era 3.13.0-37-genérico)
uname-r
3.13.0-37-generic
Remova-o e atualize o grub
sudo apt-get remove 3.13.0-37-generic
sudo update-grub
sudo shutdown -r now
Isso foi revertido para o kernel 3.13.0.24-generic que não apresenta o problema.
Eu espero que isso ajude!