Eu instalei o Ubuntu 16.04. No começo eu só tinha teclado inglês. Então adicionei lituano. Mas quando mudo o layout, ele ainda escreve porque o teclado está usando o layout em inglês. Quando abro o layout do teclado atual, vejo que ele foi alterado. Mas quando eu digito, ele simplesmente ignora. Por exemplo, inserir números (aqueles que estão abaixo das teclas F1, F2 etc.) deve gerar letras lituanas, mas ainda gera números.
Além disso, por algum motivo, as combinações de teclas não alteram o layout do teclado. Só posso alterar clicando no ícone do idioma e selecionando o idioma.
PS parece que alguém tem problema semelhante aquiSistema ignora layout de teclado selecionado. Embora isso tenha sido causado pela alteração de algumas configurações. Mas não mudei nada, apenas adicionei um layout de teclado adicional.