http://www.guitar-pro.com/en/index.php
O site oficial.
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Guitar Pro tem nativoVersão Linux. Um aplicativo de código aberto semelhante é o Tuxguitar. Você pode instalá-lo no Centro de Software.
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Wine e PlayOnLinux (ambos disponíveis no Software Center) permitirão a execução do programa.
(Eu tentei GP5, mas não 6 ... eu sei que 5 funciona)