Possível duplicata:
Por que não sincronizar pastas fora de casa com o Ubuntu One?
O Ubuntu One permite apenas /homea sincronização de pastas. Por que? Quero sincronizar a /varpasta também.
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O Ubuntu One sincroniza apenas pastas que estão em seu arquivo /home, por design. Existem vários motivos, incluindo o fato de o Ubuntu One não precisar de direitos de superusuário ou para evitar mexer na forma como os programas são instalados.