Estou usando o Ubuntu 12.04 com o pacote Xubuntu Desktop instalado e estou tendo problemas com um disco rígido NTFS interno.
Diretórios inteiros parecem ser esvaziados sem aviso prévio ou indo para a cesta de lixo. Isso vem acontecendo há pelo menos alguns meses; Percebi pela primeira vez um problema quando os arquivos de música não estavam sendo lidos na biblioteca do Rhythmbox, mas presumi que fosse um problema do Rhythmbox.
Percebi agora que um diretório com quase 500 GB de arquivos/subdiretórios foi esvaziado. O estranho, porém, é que a unidade não mostra um aumento na quantidade de espaço livre que possui - como se os arquivos ainda estivessem lá.
Ao fazer uma lspasta específica que parece estar vazia, recebo um erro de entrada/saída, mas lsa raiz da unidade pode funcionar corretamente.
Também não tenho o Windows instalado nesta máquina e a maioria das outras questões relacionadas parecem estar relacionadas à inicialização dupla do Windows.
Alguma idéia sobre a causa do problema e como corrigi-lo?
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Algumas semanas atrás, no meu sistema operacional Windows, tive problemas semelhantes que pareciam uma falha no disco rígido no seu caso. Eu executei um programa que verifica esse tipo de coisa.
Não sabia o que estava causando o problema, pois meu sistema operacional Windows congelava após 5 minutos, principalmente quando eu abria determinados programas. Então ouvi um clique massivo, o que era um sinal de morte. Depois de muita pesquisa encontrei um programa chamado Hard Drive Regenerator, seu simpático pirata deve saber onde consegui-lo; apenas queime o iso assim que ele entregar para você. O salva-vidas funciona com todos os tipos de partições e leva cerca de uma hora para verificar setores defeituosos e quase um dia se todos os setores precisarem ser remapeados e excluídos.
Os setores defeituosos estavam se espalhando como um vírus, então o programa os remapeou em uma parte do disco rígido onde os setores defeituosos falharam quando os discos rígidos são desenvolvidos. Eu executaria isso para verificar se há algum problema físico. Também fiz backup dos meus arquivos antes de executá-lo, você pode deixar, mas recomendo salvar seus arquivos. Eu tinha 1537 setores de 512 bytes fazendo com que meu disco rígido clicasse e o PC travasse. Depois de executar isso, meu disco rígido passou no teste SMART.
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Parece um problema que estou enfrentando atualmente. Eu tenho um HDD externo formatado em NTFS e estava tendo os mesmos sintomas que você. Erros de entrada/saída em todos os lugares e pastas inteiras de arquivos simplesmente desaparecendo. Após semanas de diagnósticos e tentativas de reparos, fui forçado a recuperar todos os dados possíveis e reformatar a unidade. Suspeito que o problema esteja no suporte hackeado do Linux para NTFS (já que a Microsoft não fornecerá o código para suporte adequado), mas não posso verificar isso até terminar de recuperar meus 1 TB de dados para meus numerosos HDDs pequenos e outros armazenamentos e, em seguida, reformate a unidade para ver se a unidade em si está ruim ou se realmente foi culpa do Ubuntu.
No final, meu melhor conselho é assumir o pior e começar a fazer backup de todos os dados que puder. Mude também a unidade para somente leitura para garantir que nada de novo seja gravado na unidade, aumentando ainda mais os problemas. Depois de terminar o backup, você pode A) tentar reparar a unidade usando ferramentas de reparo NTFS ou B) tentar reformatá-la para algo diferente de NTFS (eu recomendaria o Ext3 se for usado principalmente no Linux).
Desculpe, não posso ajudar mais.