Atualmente tenho 2 discos rígidos, 1 executando meu sistema operacional Windows e todos os meus aplicativos, e outro para salvar todos os meus arquivos de mídia pesados.
Se eu limpasse meu disco rígido que contém o Windows e instalasse o Ubuntu nele, meu segundo disco rígido NTFS ainda funcionaria*?
*Por trabalho, quero dizer operar aparentemente como no Windows; permitindo-me ler e gravar arquivos de mídia com facilidade.
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Sim, funcionará perfeitamente. Mas se você avaliar o desempenho em ambos os sistemas operacionais, será melhor no Windows. Ainda assim, a maioria das pessoas não consegue perceber isso.