Eu estava tentando executar o NGS QC Toolkit http://59.163.192.90:8080/ngsqctoolkit/
no Ubuntu 12.04 LTS versão de 64 bits. Mas, após executar o comando, aparece um erro informando que não é possível encontrar o módulo String::Approx
e precisa ser instalado mesmo que eu o tenha instalado com sucesso.
Aqui está o comando que usei:
perl ~/Programs/NGSQCToolkit_v2.3/QC/IlluQC_PRLL.pl -c 2 -pe /home/shrujan/Desktop/NGS_Shrujan/SRR072111_1.fastq /home/shrujan/Desktop/NGS_Shrujan/SRR072111_2.fastq 2
A Error:
Can not find module 'String::Approx'
Install it and try again
Por favor, me oriente na resolução deste problema.
Responder1
Execute os seguintes comandos:
shrujan@ubuntu:~$ cpan
cpan[1] install String::Approx
Então experimente seu NGSQCTool