O Emacs tem o insert-charrecurso: você pressiona uma combinação de teclas e obtém um menu contendo todos os caracteres Unicode com pesquisa semelhante à dmenumaioria dos inicializadores de programas do DE.
Por exemplo, para inserir "∃" (EXISTE), digito <Ctrl-x> 8 <Enter> exists <Enter>.
Existe algo semelhante que funcione em todos os programas X11?
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Eu acho que o Autokey faria o trabalho conforme descritoaqui. A ideia é que o Autokey esteja sempre em execução e possa aceitar strings arbitrárias como gatilhos.
Como a postagem descreve, você só precisa configurar o Autokey para colar caracteres Unicode e como gatilho ele pode aceitar algo como /delta, que então substitui por um δ.
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Minha sensação é que isso está fora do escopo do X11, este é um negócio de ambiente de desktop.
Para o KDE, kcharselecté uma ferramenta para escolher caracteres especiais, incluindo pesquisa. Deve atender às suas necessidades, se você colocá-lo em uma tecla de atalho global como eu fiz. Desvantagem: os caracteres são copiados para o buffer de colagem, então você precisa de mais um toque de tecla para inseri-los.