Remova espaços, exceto linhas que começam com um padrão específico

Question

Quero remover todos os espaços de um arquivo, exceto todas as linhas que começam com o mesmo padrão (o padrão é "ORGANISM").

Entrada:

Cat; Dog; Squirrel
ORGANISM Animalus terrus
Sequence: ACGTACGTACGTACGTACGTACGTACGTACGTACGTACGTACGTACGT

Saída:

Cat;Dog;Squirrel
ORGANISM Animalus terrus
Sequence:ACGTACGTACGTACGTACGTACGTACGTACGTACGTACGTACGTACGT

Não há mais espaços em nenhuma linha, exceto na linha que começa com os caracteres "ORGANISMO".

Answer 1

sed '/^ORGANISM/!s/ //g' /path/to/input

Isso removerá todos os espaços em todas as linhas que fazemnãocomeçar com ORGANISM.

Answer 2

sed -e '/^ORGANISM/n' -e 's/ //g'  < input > output

A primeira expressão salta para a nlinha ext se esta começar com ORGANISM, e se isso não acontecer, ssubstitua todos os espaços por nada ( globally)

Answer 3

Aqui está uma versão Perl usando lookahead negativo (?!ORGANISM)para descobrir se precisamos realizar a substituição. -pflags permite impressão automática

$ perl -pe 's/[[:blank:]]//g if /^(?!ORGANISM).*/' input.txt                                                             
Cat;Dog;Squirrel
ORGANISM Animalus terrus
Sequence:ACGTACGTACGTACGTACGTACGTACGTACGTACGTACGTACGTACGT