Existe algum aplicativo que permita acesso a outro sistema operacional em um computador com inicialização múltipla? Acesse como em uma máquina virtual. Onde você pode ver sua outra instalação através dele. Faça modificações, instalações e desinstalações de arquivos. E essas mudanças estão sendo refletidas no seu sistema operacional físico quando você inicializa?
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O sucesso da tentativa de inicializar um sistema operacional "nativo" em uma VM depende de vários fatores.
O primeiro é o sistema operacional que você está tentando usar como convidado. A maioria das versões do Windows sãomuitohostis à mudança de hardware abaixo deles, enquanto a maioria das versões do Linux não se importa, desde que os drivers apropriados estejam disponíveis quando o convidado é iniciado.
O segundo é o bootloader que você usa para iniciar o sistema operacional. Alguns permitem a flexibilidade de serem chamados de qualquer local de disco, físico ou não. Outros reclamam de qualquer pequena mudança. Se você instalar um segundo bootloader para lidar com diferenças nas configurações, agora você será responsável por mantê-los sincronizados caso alguma alteração seja feita.
Resumindo, é melhor não tentar isso.