Isso já aconteceu duas vezes: inicializo o win7 no boot camp e instalo as atualizações do Windows conforme indicado pelo Windows. Após a reinicialização, o osx carrega lentamente no início e o utilitário de disco me informa que há erros na partição mac. Reiniciei no RestoreDisc, onde o utilitário de disco diz que não pode corrigir erros e formatar o disco inteiro! Inicializei o Windows novamente e vi que há uma pasta temporária na partição do Mac cheia de executáveis do Windows! Agora eu li que as atualizações do win7 gravarão em qualquer partição adjacente, usando-a como uma unidade de troca!
ATUALIZAÇÃO: Decidi não continuar me punindo e peguei o Parallels7. Aparentemente, o W!ndow$ usa a próxima partição como uma unidade de troca, independentemente de ter acesso ou não. eca.
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Não testei isso, mas entendo que você pode evitar esse problema desmontando o volume do OS X antes de executar o Windows Update. Esta dica do Mac OS Xsugere usar o mountvolcomando para montar e desmontar o volume. Este artigo da base de conhecimento da Applesugere desativar temporariamente o driver AppleMNT.sys e reinicializar.