Os aplicativos não aparecerão no Gnome Shell, mas aparecerão na barra "Favoritos" e poderão ser pesquisados.
Por exemplo, se eu pesquisar algo escrito incorretamente ("chrmium"), não mostra nada, porém, se eu pesquisar algo corretamente ("chromium"), ele exibe o cabeçalho "Aplicativos". Isso significa que ele está procurando aplicativos corretamente, mas simplesmente não os exibe.
Estou executando o OpenSUSE 12.1 x64 em uma VM Virtual Box.