eu tenho umMouse Bluetooth para notebook Microsoft 5000e tive o mesmo problema com dois laptops, um Sony Vaio Z e agora um Lenovo Thinkpad T420s:
Posso emparelhar o dispositivo Bluetooth com o computador e ele funciona bem até que eu reinicie ou coloque o laptop em suspensão (hibernação total ou apenas feche a tampa por um tempo).
Em ambos os casos, o mouse desligará automaticamente após algum tempo. Porém, quando ligo o mouse novamente, a única maneira de usá-lo novamente é abrir o gerenciador de dispositivos Bluetooth do KDE, remover o dispositivo existente, detectá-lo novamente e adicioná-lo novamente.
Eu 'confiei' no mouse no gerenciador de dispositivos Bluetooth.
Estou usando o Debian squeeze, com kernel 3.2.0 de backports.
Minhas pesquisas no Google encontraram muitas pessoas com problemas semelhantes ou idênticos, mas sem solução.
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Você tentou reiniciar o serviço bluetooth com:
sudo systemctl restart bluetooth.servicedepois de acordar? Se isso funcionar, você pode acionar a reinicialização com algo assim:
https://askubuntu.com/questions/308067/how-to-run-a-script-after-or-before-hibernate