A estrutura do arquivo em um sistema operacional de 64 bits é diferente da estrutura do mesmo sistema operacional de 32 bits? Eu sei que isso pode depender do sistema operacional, mas vi uma postagem informando que os arquivos eram diferentes.
Como exemplo prático, posso copiar um arquivo de texto ou binário de um sistema de 64 bits para um sistema de 32 bits sem problemas? Presumo que seja esse o caso, pois é assim que as coisas funcionam no Windows.
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Que eu saiba, não existem sistemas de arquivos comuns que dependam de uma arquitetura de processador específica. EXT(2,3,4) são o mesmo sistema de arquivos em um ARM, x86, x64, ia64, ppc, mips ou qualquer outra CPU.
Os arquivos armazenados no sistema de arquivos estarão disponíveis em qualquer sistema que possa montar o sistema de arquivos.
É claro que qualquer conteúdo executável (programas) só será executado em uma arquitetura apropriada.
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Você pode usar o ZFS de 128 bits com um sistema operacional de 32 bits. Não há relação entre sistemas operacionais e tamanhos respectivos de sistemas de arquivos.