Existem muitas ferramentas como parted
e, fdisk
mas todas elas não são muito fáceis de usar. Algo parecido com o Partition Magic, mas para CLI Linux? Algo que ajuste automaticamente a tabela de partições, verifique o FS, remova temporariamente o registro no diário (se necessário), etc.? Em uma linha de comando :)
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O Parted já faz tudo o que você mencionou e é tão amigável quanto você obteria em uma ferramenta CLI (mas adoraria provar que estou errado aqui).
O Fdisk não opera em sistemas de arquivos - opera apenas em partições, AFAIK, o que significa que provavelmente não é o que você está procurando.
Para X, tenho certeza que você já conhece o gparted.