Eu uso Putty para SSH em servidores Linux no trabalho.
Suponha que outra janela seja coberta com massa. Depois que movo a janela, o Putty se repinta - mas muito, muito lentamente. Na verdade, posso vê-lo desenhando linha por linha. A rolagem das linhas no PuTTY também é muito lenta.
O que poderia estar causando isso?
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Percebi isso com o PuTTY mesmo no Windows 7 e 8 (em desktops Core i7). Eu uso monitores de resolução muito alta (2560 x 1440), e se a janela do PuTTY for grande e eu usar a roda do mouse para rolar, posso ver a repintura. É extremamente irritante.
Meu palpite é que é um problema com o mecanismo de composição do Windows em geral. Em um Mac, o terminal é incrivelmente suave e responsivo. O mesmo no Linux (Ubuntu 13.10) com Compiz habilitado (e "janelas instáveis").
Examinei algumas alternativas de terminal SSH para Windows, como DameWare e TeraTerm, e a história é praticamente a mesma. Minha "teoria" é que Mac e Linux usam composição OpenGL (acelerada por GPU), enquanto o Windows é... bem... não tenho certeza do que está fazendo, mas não funciona tão bem.