É possível executar o Transmission ou o Google Chrome apenas usando OpenVPN? Outros aplicativos devem usar a conexão padrão (eth0), pois estou conectado à intranet, que não estará acessível se todo o tráfego for roteado por VPN.
Estou usando o Ubuntu 12.10 e algum servidor VPN Premium (semelhante aoVPN HMS)
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Google Chrome - sim, você pode configurar um proxy do outro lado e, em seguida, uma rota estática específica que diz que para acessar esse proxy você deve passar pelo túnel OpenVPN. Isso não seria muito difícil de fazer.
Para transmissão, você pode configurar um proxy SOCKS5.
Este artigo explica como você pode configurar o SSH para ser um proxy SOCKS5:http://www.catonmat.net/blog/linux-socks5-proxy/. Você então poderá conectar o Chrome e o Transmission a isso. Não há necessidade de se preocupar com o OpenVPN se você tiver acesso ssh à caixa.