Estou executando o Ubuntu 13.04 de 64 bits e tenho um diretório com 2 pastas e um arquivo nele. O problema é que apenas uma dessas pastas está realmente visível no gerenciador visual de arquivos:
Você pode ver que a binpasta existe e, no entanto, tenho direitos para acessá-la. Notei que isso aconteceu antes com alguns outros diretórios aleatórios. O que poderia estar causando isso?
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Resolvi esse problema pressionando F5o gerenciador de arquivos com o diretório aberto.