É possível customizar versões de pacotes como "binutils, Glibc, libstd.." durante a instalação do sistema operacional??
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Não durante a instalação não. Durante o processo de instalação você está instalando pacotes do rpms. Não há como editar o conteúdo do rpm durante o processo de instalação. Sua melhor aposta seria instalar um sistema mínimo, fazer login, fazer as alterações desejadas nas várias fontes e depois instalar os pacotes modificados.